Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SmagpQ99KC7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SmagpQ99KC7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SmagpQ99KC7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SmagpQ99KC7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SmagpQ99KC7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SmagpQ99KC7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SmagpQ99KC7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SmagpQ99KC7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SmagpQ99KC7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SmagpQ99KC7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SmagpQ99KC7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SmagpQ99KC7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SmagpQ99KC7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SmagpQ99KC7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SmagpQ99KC7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SmagpQ99KC7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SmagpQ99KC7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SmagpQ99KC7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SmagpQ99KC7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmagpQ99KC7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmagpQ99KC7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SmagpQ99KC7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SmagpQ99KC7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SmagpQ99KC7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SmagpQ99KC7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SmagpQ99KC7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SmagpQ99KC7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SmagpQ99KC7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SmagpQ99KC7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SmagpQ99KC7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SmagpQ99KC7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms