Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GatbQ99JT1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GatbQ99JT1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GatbQ99JT1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GatbQ99JT1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GatbQ99JT1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GatbQ99JT1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GatbQ99JT1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GatbQ99JT1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GatbQ99JT1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GatbQ99JT1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GatbQ99JT1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GatbQ99JT1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GatbQ99JT1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GatbQ99JT1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GatbQ99JT1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GatbQ99JT1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GatbQ99JT1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GatbQ99JT1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GatbQ99JT1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GatbQ99JT1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GatbQ99JT1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GatbQ99JT1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GatbQ99JT1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GatbQ99JT1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GatbQ99JT1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GatbQ99JT1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GatbQ99JT1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GatbQ99JT1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GatbQ99JT1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GatbQ99JT1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GatbQ99JT1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GatbQ99JT1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GatbQ99JT1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GatbQ99JT1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GatbQ99JT1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GatbQ99JT1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GatbQ99JT1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GatbQ99JT1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GatbQ99JT1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GatbQ99JT1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GatbQ99JT1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GatbQ99JT1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GatbQ99JT1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GatbQ99JT1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GatbQ99JT1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GatbQ99JT1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GatbQ99JT1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GatbQ99JT1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GatbQ99JT1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GatbQ99JT1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GatbQ99JT1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GatbQ99JT1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GatbQ99JT1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GatbQ99JT1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GatbQ99JT1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GatbQ99JT1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GatbQ99JT1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GatbQ99JT1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GatbQ99JT1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GatbQ99JT1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GatbQ99JT1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GatbQ99JT1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GatbQ99JT1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GatbQ99JT1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GatbQ99JT1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GatbQ99JT1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
GatbQ99JT1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GatbQ99JT1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms