Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Def8Q99J78 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Def8Q99J78 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Def8Q99J78 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Def8Q99J78 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Def8Q99J78 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Def8Q99J78 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Def8Q99J78 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Def8Q99J78 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Def8Q99J78 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Def8Q99J78 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Def8Q99J78 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Def8Q99J78 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Def8Q99J78 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Def8Q99J78 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Def8Q99J78 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Def8Q99J78 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Def8Q99J78 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Def8Q99J78 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Def8Q99J78 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Def8Q99J78 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Def8Q99J78 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Def8Q99J78 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Def8Q99J78 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Def8Q99J78 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Def8Q99J78 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Def8Q99J78 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Def8Q99J78 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Def8Q99J78 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Def8Q99J78 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Def8Q99J78 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Def8Q99J78 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Def8Q99J78 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Def8Q99J78 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Def8Q99J78 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Def8Q99J78 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Def8Q99J78 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Def8Q99J78 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Def8Q99J78 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Def8Q99J78 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Def8Q99J78 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Def8Q99J78 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Def8Q99J78 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Def8Q99J78 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Def8Q99J78 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Def8Q99J78 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Def8Q99J78 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Def8Q99J78 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Def8Q99J78 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Def8Q99J78 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Def8Q99J78 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Def8Q99J78 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Def8Q99J78 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Def8Q99J78 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Def8Q99J78 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Def8Q99J78 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Def8Q99J78 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Def8Q99J78 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Def8Q99J78 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Def8Q99J78 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Def8Q99J78 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Def8Q99J78 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Def8Q99J78 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Def8Q99J78 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Def8Q99J78 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Def8Q99J78 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Def8Q99J78 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Def8Q99J78 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Def8Q99J78 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Def8Q99J78 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms