Protein–RNA interactions for Protein: Q921I9

Exosc4, Exosome complex component RRP41, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc4Q921I9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Exosc4Q921I9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Exosc4Q921I9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exosc4Q921I9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Exosc4Q921I9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc4Q921I9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc4Q921I9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc4Q921I9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc4Q921I9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc4Q921I9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc4Q921I9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc4Q921I9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc4Q921I9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Exosc4Q921I9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Exosc4Q921I9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Exosc4Q921I9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Exosc4Q921I9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Exosc4Q921I9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc4Q921I9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc4Q921I9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc4Q921I9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc4Q921I9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Exosc4Q921I9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Exosc4Q921I9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Exosc4Q921I9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Exosc4Q921I9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc4Q921I9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc4Q921I9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc4Q921I9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Exosc4Q921I9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Exosc4Q921I9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Exosc4Q921I9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc4Q921I9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc4Q921I9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Exosc4Q921I9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Exosc4Q921I9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc4Q921I9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Exosc4Q921I9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Exosc4Q921I9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Exosc4Q921I9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Exosc4Q921I9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Exosc4Q921I9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc4Q921I9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc4Q921I9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc4Q921I9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Exosc4Q921I9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Exosc4Q921I9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Exosc4Q921I9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc4Q921I9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc4Q921I9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Exosc4Q921I9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Exosc4Q921I9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc4Q921I9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc4Q921I9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc4Q921I9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc4Q921I9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc4Q921I9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc4Q921I9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc4Q921I9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Exosc4Q921I9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc4Q921I9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc4Q921I9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc4Q921I9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc4Q921I9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc4Q921I9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc4Q921I9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc4Q921I9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Exosc4Q921I9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc4Q921I9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Exosc4Q921I9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Exosc4Q921I9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Exosc4Q921I9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc4Q921I9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Exosc4Q921I9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms