Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp3Q91W36 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp3Q91W36 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp3Q91W36 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp3Q91W36 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp3Q91W36 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp3Q91W36 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp3Q91W36 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp3Q91W36 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp3Q91W36 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp3Q91W36 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp3Q91W36 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp3Q91W36 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp3Q91W36 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp3Q91W36 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp3Q91W36 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp3Q91W36 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp3Q91W36 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp3Q91W36 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp3Q91W36 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp3Q91W36 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp3Q91W36 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp3Q91W36 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp3Q91W36 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp3Q91W36 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp3Q91W36 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp3Q91W36 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp3Q91W36 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp3Q91W36 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp3Q91W36 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp3Q91W36 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp3Q91W36 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp3Q91W36 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp3Q91W36 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp3Q91W36 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp3Q91W36 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp3Q91W36 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp3Q91W36 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp3Q91W36 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp3Q91W36 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Usp3Q91W36 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp3Q91W36 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp3Q91W36 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp3Q91W36 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp3Q91W36 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp3Q91W36 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp3Q91W36 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp3Q91W36 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp3Q91W36 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp3Q91W36 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp3Q91W36 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp3Q91W36 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp3Q91W36 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp3Q91W36 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp3Q91W36 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp3Q91W36 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp3Q91W36 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp3Q91W36 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp3Q91W36 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp3Q91W36 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp3Q91W36 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp3Q91W36 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp3Q91W36 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp3Q91W36 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp3Q91W36 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp3Q91W36 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp3Q91W36 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp3Q91W36 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp3Q91W36 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp3Q91W36 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp3Q91W36 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp3Q91W36 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp3Q91W36 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp3Q91W36 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp3Q91W36 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp3Q91W36 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp3Q91W36 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp3Q91W36 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp3Q91W36 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp3Q91W36 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp3Q91W36 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp3Q91W36 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp3Q91W36 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp3Q91W36 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp3Q91W36 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp3Q91W36 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp3Q91W36 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp3Q91W36 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp3Q91W36 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp3Q91W36 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp3Q91W36 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp3Q91W36 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp3Q91W36 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp3Q91W36 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp3Q91W36 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp3Q91W36 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp3Q91W36 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp3Q91W36 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp3Q91W36 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp3Q91W36 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms