Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh10Q8VCH7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh10Q8VCH7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh10Q8VCH7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh10Q8VCH7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh10Q8VCH7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh10Q8VCH7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdh10Q8VCH7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh10Q8VCH7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh10Q8VCH7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdh10Q8VCH7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rdh10Q8VCH7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh10Q8VCH7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rdh10Q8VCH7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rdh10Q8VCH7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh10Q8VCH7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh10Q8VCH7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh10Q8VCH7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh10Q8VCH7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh10Q8VCH7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rdh10Q8VCH7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rdh10Q8VCH7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rdh10Q8VCH7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh10Q8VCH7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rdh10Q8VCH7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rdh10Q8VCH7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdh10Q8VCH7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rdh10Q8VCH7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rdh10Q8VCH7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh10Q8VCH7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh10Q8VCH7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh10Q8VCH7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rdh10Q8VCH7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rdh10Q8VCH7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rdh10Q8VCH7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rdh10Q8VCH7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdh10Q8VCH7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rdh10Q8VCH7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rdh10Q8VCH7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdh10Q8VCH7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rdh10Q8VCH7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh10Q8VCH7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rdh10Q8VCH7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh10Q8VCH7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh10Q8VCH7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh10Q8VCH7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rdh10Q8VCH7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rdh10Q8VCH7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdh10Q8VCH7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rdh10Q8VCH7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh10Q8VCH7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh10Q8VCH7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rdh10Q8VCH7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rdh10Q8VCH7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh10Q8VCH7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rdh10Q8VCH7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh10Q8VCH7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh10Q8VCH7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rdh10Q8VCH7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rdh10Q8VCH7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rdh10Q8VCH7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh10Q8VCH7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rdh10Q8VCH7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh10Q8VCH7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh10Q8VCH7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh10Q8VCH7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh10Q8VCH7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdh10Q8VCH7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh10Q8VCH7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdh10Q8VCH7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdh10Q8VCH7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdh10Q8VCH7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdh10Q8VCH7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdh10Q8VCH7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdh10Q8VCH7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdh10Q8VCH7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdh10Q8VCH7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdh10Q8VCH7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdh10Q8VCH7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdh10Q8VCH7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rdh10Q8VCH7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rdh10Q8VCH7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rdh10Q8VCH7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rdh10Q8VCH7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rdh10Q8VCH7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh10Q8VCH7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh10Q8VCH7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rdh10Q8VCH7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh10Q8VCH7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh10Q8VCH7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rdh10Q8VCH7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh10Q8VCH7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rdh10Q8VCH7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh10Q8VCH7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rdh10Q8VCH7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rdh10Q8VCH7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh10Q8VCH7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rdh10Q8VCH7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms