Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MpdzQ8VBX6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MpdzQ8VBX6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MpdzQ8VBX6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MpdzQ8VBX6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MpdzQ8VBX6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MpdzQ8VBX6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MpdzQ8VBX6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MpdzQ8VBX6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MpdzQ8VBX6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MpdzQ8VBX6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MpdzQ8VBX6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MpdzQ8VBX6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MpdzQ8VBX6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MpdzQ8VBX6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MpdzQ8VBX6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MpdzQ8VBX6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MpdzQ8VBX6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MpdzQ8VBX6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MpdzQ8VBX6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MpdzQ8VBX6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MpdzQ8VBX6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MpdzQ8VBX6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MpdzQ8VBX6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MpdzQ8VBX6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MpdzQ8VBX6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MpdzQ8VBX6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MpdzQ8VBX6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MpdzQ8VBX6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MpdzQ8VBX6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MpdzQ8VBX6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MpdzQ8VBX6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MpdzQ8VBX6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MpdzQ8VBX6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MpdzQ8VBX6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MpdzQ8VBX6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MpdzQ8VBX6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MpdzQ8VBX6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MpdzQ8VBX6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MpdzQ8VBX6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MpdzQ8VBX6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MpdzQ8VBX6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MpdzQ8VBX6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MpdzQ8VBX6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MpdzQ8VBX6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MpdzQ8VBX6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MpdzQ8VBX6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MpdzQ8VBX6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MpdzQ8VBX6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MpdzQ8VBX6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MpdzQ8VBX6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MpdzQ8VBX6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MpdzQ8VBX6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MpdzQ8VBX6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MpdzQ8VBX6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MpdzQ8VBX6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MpdzQ8VBX6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MpdzQ8VBX6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MpdzQ8VBX6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MpdzQ8VBX6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MpdzQ8VBX6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MpdzQ8VBX6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MpdzQ8VBX6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MpdzQ8VBX6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MpdzQ8VBX6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MpdzQ8VBX6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MpdzQ8VBX6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MpdzQ8VBX6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MpdzQ8VBX6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MpdzQ8VBX6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MpdzQ8VBX6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MpdzQ8VBX6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MpdzQ8VBX6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MpdzQ8VBX6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MpdzQ8VBX6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MpdzQ8VBX6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MpdzQ8VBX6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MpdzQ8VBX6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MpdzQ8VBX6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MpdzQ8VBX6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MpdzQ8VBX6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MpdzQ8VBX6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MpdzQ8VBX6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MpdzQ8VBX6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MpdzQ8VBX6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MpdzQ8VBX6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MpdzQ8VBX6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MpdzQ8VBX6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MpdzQ8VBX6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms