Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N0

Ccdc59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc59Q8R2N0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc59Q8R2N0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc59Q8R2N0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc59Q8R2N0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc59Q8R2N0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc59Q8R2N0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc59Q8R2N0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc59Q8R2N0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc59Q8R2N0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc59Q8R2N0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc59Q8R2N0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc59Q8R2N0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc59Q8R2N0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc59Q8R2N0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc59Q8R2N0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc59Q8R2N0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc59Q8R2N0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc59Q8R2N0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc59Q8R2N0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc59Q8R2N0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc59Q8R2N0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc59Q8R2N0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc59Q8R2N0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc59Q8R2N0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc59Q8R2N0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc59Q8R2N0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc59Q8R2N0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc59Q8R2N0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc59Q8R2N0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc59Q8R2N0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc59Q8R2N0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc59Q8R2N0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc59Q8R2N0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc59Q8R2N0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc59Q8R2N0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc59Q8R2N0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc59Q8R2N0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc59Q8R2N0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc59Q8R2N0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc59Q8R2N0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc59Q8R2N0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc59Q8R2N0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc59Q8R2N0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc59Q8R2N0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc59Q8R2N0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc59Q8R2N0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc59Q8R2N0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc59Q8R2N0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc59Q8R2N0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc59Q8R2N0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc59Q8R2N0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc59Q8R2N0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc59Q8R2N0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc59Q8R2N0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc59Q8R2N0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc59Q8R2N0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc59Q8R2N0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc59Q8R2N0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc59Q8R2N0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc59Q8R2N0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc59Q8R2N0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc59Q8R2N0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc59Q8R2N0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc59Q8R2N0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc59Q8R2N0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc59Q8R2N0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc59Q8R2N0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc59Q8R2N0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc59Q8R2N0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc59Q8R2N0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc59Q8R2N0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc59Q8R2N0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc59Q8R2N0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc59Q8R2N0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc59Q8R2N0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc59Q8R2N0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc59Q8R2N0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc59Q8R2N0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc59Q8R2N0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc59Q8R2N0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc59Q8R2N0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc59Q8R2N0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc59Q8R2N0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc59Q8R2N0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc59Q8R2N0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc59Q8R2N0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc59Q8R2N0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms