Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx19Q8R1Q0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx19Q8R1Q0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx19Q8R1Q0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx19Q8R1Q0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stx19Q8R1Q0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx19Q8R1Q0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx19Q8R1Q0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx19Q8R1Q0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stx19Q8R1Q0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx19Q8R1Q0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx19Q8R1Q0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx19Q8R1Q0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx19Q8R1Q0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx19Q8R1Q0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stx19Q8R1Q0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx19Q8R1Q0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx19Q8R1Q0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx19Q8R1Q0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Stx19Q8R1Q0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx19Q8R1Q0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx19Q8R1Q0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx19Q8R1Q0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx19Q8R1Q0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx19Q8R1Q0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx19Q8R1Q0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx19Q8R1Q0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx19Q8R1Q0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx19Q8R1Q0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx19Q8R1Q0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx19Q8R1Q0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Stx19Q8R1Q0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx19Q8R1Q0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx19Q8R1Q0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx19Q8R1Q0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx19Q8R1Q0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx19Q8R1Q0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx19Q8R1Q0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx19Q8R1Q0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx19Q8R1Q0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx19Q8R1Q0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx19Q8R1Q0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx19Q8R1Q0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx19Q8R1Q0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx19Q8R1Q0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx19Q8R1Q0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stx19Q8R1Q0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx19Q8R1Q0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx19Q8R1Q0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx19Q8R1Q0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx19Q8R1Q0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx19Q8R1Q0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx19Q8R1Q0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx19Q8R1Q0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx19Q8R1Q0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx19Q8R1Q0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx19Q8R1Q0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx19Q8R1Q0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stx19Q8R1Q0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx19Q8R1Q0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stx19Q8R1Q0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stx19Q8R1Q0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Stx19Q8R1Q0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Stx19Q8R1Q0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stx19Q8R1Q0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx19Q8R1Q0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx19Q8R1Q0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx19Q8R1Q0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stx19Q8R1Q0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stx19Q8R1Q0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stx19Q8R1Q0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stx19Q8R1Q0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx19Q8R1Q0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stx19Q8R1Q0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stx19Q8R1Q0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms