Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SbsnQ8CIT9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbsnQ8CIT9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SbsnQ8CIT9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SbsnQ8CIT9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SbsnQ8CIT9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SbsnQ8CIT9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SbsnQ8CIT9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SbsnQ8CIT9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SbsnQ8CIT9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SbsnQ8CIT9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SbsnQ8CIT9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SbsnQ8CIT9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SbsnQ8CIT9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SbsnQ8CIT9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SbsnQ8CIT9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SbsnQ8CIT9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SbsnQ8CIT9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SbsnQ8CIT9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SbsnQ8CIT9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SbsnQ8CIT9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SbsnQ8CIT9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SbsnQ8CIT9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SbsnQ8CIT9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SbsnQ8CIT9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SbsnQ8CIT9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SbsnQ8CIT9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SbsnQ8CIT9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SbsnQ8CIT9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SbsnQ8CIT9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SbsnQ8CIT9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SbsnQ8CIT9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SbsnQ8CIT9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SbsnQ8CIT9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SbsnQ8CIT9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SbsnQ8CIT9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SbsnQ8CIT9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SbsnQ8CIT9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SbsnQ8CIT9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SbsnQ8CIT9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SbsnQ8CIT9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SbsnQ8CIT9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SbsnQ8CIT9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbsnQ8CIT9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbsnQ8CIT9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SbsnQ8CIT9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SbsnQ8CIT9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SbsnQ8CIT9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SbsnQ8CIT9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SbsnQ8CIT9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SbsnQ8CIT9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SbsnQ8CIT9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SbsnQ8CIT9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SbsnQ8CIT9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SbsnQ8CIT9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SbsnQ8CIT9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SbsnQ8CIT9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SbsnQ8CIT9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SbsnQ8CIT9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SbsnQ8CIT9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SbsnQ8CIT9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SbsnQ8CIT9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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