Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E330017A01RikQ8BU47 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
E330017A01RikQ8BU47 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E330017A01RikQ8BU47 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E330017A01RikQ8BU47 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E330017A01RikQ8BU47 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E330017A01RikQ8BU47 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
E330017A01RikQ8BU47 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E330017A01RikQ8BU47 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E330017A01RikQ8BU47 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E330017A01RikQ8BU47 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E330017A01RikQ8BU47 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
E330017A01RikQ8BU47 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E330017A01RikQ8BU47 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
E330017A01RikQ8BU47 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
E330017A01RikQ8BU47 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
E330017A01RikQ8BU47 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
E330017A01RikQ8BU47 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
E330017A01RikQ8BU47 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
E330017A01RikQ8BU47 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
E330017A01RikQ8BU47 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E330017A01RikQ8BU47 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E330017A01RikQ8BU47 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
E330017A01RikQ8BU47 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
E330017A01RikQ8BU47 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
E330017A01RikQ8BU47 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E330017A01RikQ8BU47 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
E330017A01RikQ8BU47 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
E330017A01RikQ8BU47 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
E330017A01RikQ8BU47 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
E330017A01RikQ8BU47 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E330017A01RikQ8BU47 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
E330017A01RikQ8BU47 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
E330017A01RikQ8BU47 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
E330017A01RikQ8BU47 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
E330017A01RikQ8BU47 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
E330017A01RikQ8BU47 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
E330017A01RikQ8BU47 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
E330017A01RikQ8BU47 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
E330017A01RikQ8BU47 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
E330017A01RikQ8BU47 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
E330017A01RikQ8BU47 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E330017A01RikQ8BU47 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E330017A01RikQ8BU47 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
E330017A01RikQ8BU47 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
E330017A01RikQ8BU47 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
E330017A01RikQ8BU47 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
E330017A01RikQ8BU47 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
E330017A01RikQ8BU47 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
E330017A01RikQ8BU47 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
E330017A01RikQ8BU47 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E330017A01RikQ8BU47 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
E330017A01RikQ8BU47 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
E330017A01RikQ8BU47 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E330017A01RikQ8BU47 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
E330017A01RikQ8BU47 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
E330017A01RikQ8BU47 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E330017A01RikQ8BU47 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E330017A01RikQ8BU47 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E330017A01RikQ8BU47 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E330017A01RikQ8BU47 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
E330017A01RikQ8BU47 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E330017A01RikQ8BU47 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
E330017A01RikQ8BU47 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
E330017A01RikQ8BU47 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
E330017A01RikQ8BU47 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
E330017A01RikQ8BU47 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
E330017A01RikQ8BU47 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
E330017A01RikQ8BU47 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E330017A01RikQ8BU47 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E330017A01RikQ8BU47 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
E330017A01RikQ8BU47 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E330017A01RikQ8BU47 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E330017A01RikQ8BU47 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E330017A01RikQ8BU47 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E330017A01RikQ8BU47 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms