Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl42Q8BFQ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl42Q8BFQ9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl42Q8BFQ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl42Q8BFQ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klhl42Q8BFQ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl42Q8BFQ9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl42Q8BFQ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl42Q8BFQ9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl42Q8BFQ9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl42Q8BFQ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Klhl42Q8BFQ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl42Q8BFQ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klhl42Q8BFQ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klhl42Q8BFQ9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klhl42Q8BFQ9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhl42Q8BFQ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl42Q8BFQ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl42Q8BFQ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhl42Q8BFQ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhl42Q8BFQ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Klhl42Q8BFQ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhl42Q8BFQ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl42Q8BFQ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl42Q8BFQ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl42Q8BFQ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl42Q8BFQ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl42Q8BFQ9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl42Q8BFQ9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl42Q8BFQ9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl42Q8BFQ9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl42Q8BFQ9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl42Q8BFQ9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl42Q8BFQ9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl42Q8BFQ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl42Q8BFQ9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl42Q8BFQ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl42Q8BFQ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl42Q8BFQ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl42Q8BFQ9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl42Q8BFQ9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl42Q8BFQ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl42Q8BFQ9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl42Q8BFQ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl42Q8BFQ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl42Q8BFQ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl42Q8BFQ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl42Q8BFQ9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl42Q8BFQ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl42Q8BFQ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl42Q8BFQ9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl42Q8BFQ9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl42Q8BFQ9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl42Q8BFQ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl42Q8BFQ9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl42Q8BFQ9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl42Q8BFQ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhl42Q8BFQ9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl42Q8BFQ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl42Q8BFQ9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl42Q8BFQ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl42Q8BFQ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl42Q8BFQ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl42Q8BFQ9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl42Q8BFQ9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl42Q8BFQ9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl42Q8BFQ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl42Q8BFQ9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl42Q8BFQ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl42Q8BFQ9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl42Q8BFQ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl42Q8BFQ9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl42Q8BFQ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms