Protein–RNA interactions for Protein: Q80WP8

Gadl1, Acidic amino acid decarboxylase GADL1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadl1Q80WP8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadl1Q80WP8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadl1Q80WP8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gadl1Q80WP8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gadl1Q80WP8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gadl1Q80WP8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gadl1Q80WP8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gadl1Q80WP8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gadl1Q80WP8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gadl1Q80WP8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gadl1Q80WP8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gadl1Q80WP8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gadl1Q80WP8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gadl1Q80WP8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gadl1Q80WP8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gadl1Q80WP8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gadl1Q80WP8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gadl1Q80WP8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gadl1Q80WP8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gadl1Q80WP8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gadl1Q80WP8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gadl1Q80WP8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gadl1Q80WP8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gadl1Q80WP8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Gadl1Q80WP8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gadl1Q80WP8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gadl1Q80WP8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gadl1Q80WP8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gadl1Q80WP8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadl1Q80WP8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gadl1Q80WP8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gadl1Q80WP8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gadl1Q80WP8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gadl1Q80WP8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gadl1Q80WP8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gadl1Q80WP8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadl1Q80WP8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadl1Q80WP8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadl1Q80WP8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadl1Q80WP8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadl1Q80WP8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadl1Q80WP8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadl1Q80WP8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gadl1Q80WP8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadl1Q80WP8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadl1Q80WP8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadl1Q80WP8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadl1Q80WP8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadl1Q80WP8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadl1Q80WP8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadl1Q80WP8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadl1Q80WP8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadl1Q80WP8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadl1Q80WP8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadl1Q80WP8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadl1Q80WP8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadl1Q80WP8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadl1Q80WP8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadl1Q80WP8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadl1Q80WP8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gadl1Q80WP8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadl1Q80WP8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadl1Q80WP8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadl1Q80WP8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadl1Q80WP8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadl1Q80WP8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gadl1Q80WP8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gadl1Q80WP8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadl1Q80WP8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadl1Q80WP8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadl1Q80WP8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadl1Q80WP8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadl1Q80WP8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadl1Q80WP8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadl1Q80WP8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gadl1Q80WP8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadl1Q80WP8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadl1Q80WP8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadl1Q80WP8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadl1Q80WP8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadl1Q80WP8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gadl1Q80WP8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gadl1Q80WP8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gadl1Q80WP8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadl1Q80WP8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms