Protein–RNA interactions for Protein: Q80V31

Cep104, Centrosomal protein of 104 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep104Q80V31 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cep104Q80V31 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cep104Q80V31 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cep104Q80V31 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cep104Q80V31 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cep104Q80V31 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cep104Q80V31 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cep104Q80V31 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cep104Q80V31 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep104Q80V31 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cep104Q80V31 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep104Q80V31 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cep104Q80V31 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep104Q80V31 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cep104Q80V31 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cep104Q80V31 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cep104Q80V31 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cep104Q80V31 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cep104Q80V31 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cep104Q80V31 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep104Q80V31 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep104Q80V31 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep104Q80V31 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep104Q80V31 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep104Q80V31 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep104Q80V31 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep104Q80V31 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cep104Q80V31 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep104Q80V31 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep104Q80V31 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep104Q80V31 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep104Q80V31 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep104Q80V31 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep104Q80V31 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep104Q80V31 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep104Q80V31 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep104Q80V31 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep104Q80V31 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cep104Q80V31 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cep104Q80V31 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cep104Q80V31 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cep104Q80V31 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep104Q80V31 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cep104Q80V31 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep104Q80V31 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep104Q80V31 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep104Q80V31 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep104Q80V31 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cep104Q80V31 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cep104Q80V31 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep104Q80V31 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep104Q80V31 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep104Q80V31 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep104Q80V31 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep104Q80V31 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep104Q80V31 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep104Q80V31 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep104Q80V31 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep104Q80V31 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep104Q80V31 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep104Q80V31 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep104Q80V31 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep104Q80V31 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep104Q80V31 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep104Q80V31 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep104Q80V31 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cep104Q80V31 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep104Q80V31 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cep104Q80V31 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep104Q80V31 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep104Q80V31 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep104Q80V31 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep104Q80V31 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep104Q80V31 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cep104Q80V31 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep104Q80V31 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cep104Q80V31 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cep104Q80V31 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cep104Q80V31 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cep104Q80V31 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cep104Q80V31 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cep104Q80V31 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cep104Q80V31 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep104Q80V31 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep104Q80V31 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cep104Q80V31 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cep104Q80V31 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cep104Q80V31 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep104Q80V31 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cep104Q80V31 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep104Q80V31 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep104Q80V31 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cep104Q80V31 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cep104Q80V31 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cep104Q80V31 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cep104Q80V31 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cep104Q80V31 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cep104Q80V31 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cep104Q80V31 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cep104Q80V31 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms