Protein–RNA interactions for Protein: Q80TB8

Vat1l, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1lQ80TB8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vat1lQ80TB8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vat1lQ80TB8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vat1lQ80TB8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vat1lQ80TB8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vat1lQ80TB8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vat1lQ80TB8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vat1lQ80TB8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vat1lQ80TB8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vat1lQ80TB8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vat1lQ80TB8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vat1lQ80TB8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vat1lQ80TB8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vat1lQ80TB8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Vat1lQ80TB8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vat1lQ80TB8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vat1lQ80TB8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vat1lQ80TB8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vat1lQ80TB8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vat1lQ80TB8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vat1lQ80TB8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vat1lQ80TB8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vat1lQ80TB8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vat1lQ80TB8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vat1lQ80TB8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vat1lQ80TB8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Vat1lQ80TB8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vat1lQ80TB8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vat1lQ80TB8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vat1lQ80TB8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vat1lQ80TB8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vat1lQ80TB8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Vat1lQ80TB8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vat1lQ80TB8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Vat1lQ80TB8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vat1lQ80TB8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vat1lQ80TB8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vat1lQ80TB8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Vat1lQ80TB8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Vat1lQ80TB8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Vat1lQ80TB8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vat1lQ80TB8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vat1lQ80TB8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Vat1lQ80TB8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Vat1lQ80TB8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vat1lQ80TB8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vat1lQ80TB8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Vat1lQ80TB8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Vat1lQ80TB8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vat1lQ80TB8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Vat1lQ80TB8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vat1lQ80TB8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vat1lQ80TB8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vat1lQ80TB8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vat1lQ80TB8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vat1lQ80TB8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vat1lQ80TB8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vat1lQ80TB8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Vat1lQ80TB8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vat1lQ80TB8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vat1lQ80TB8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vat1lQ80TB8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vat1lQ80TB8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vat1lQ80TB8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vat1lQ80TB8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Vat1lQ80TB8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vat1lQ80TB8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vat1lQ80TB8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vat1lQ80TB8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vat1lQ80TB8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vat1lQ80TB8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vat1lQ80TB8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Vat1lQ80TB8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vat1lQ80TB8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vat1lQ80TB8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vat1lQ80TB8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vat1lQ80TB8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vat1lQ80TB8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vat1lQ80TB8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vat1lQ80TB8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vat1lQ80TB8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vat1lQ80TB8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Vat1lQ80TB8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Vat1lQ80TB8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Vat1lQ80TB8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Vat1lQ80TB8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vat1lQ80TB8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms