Protein–RNA interactions for Protein: Q71FD5

Znrf2, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf2Q71FD5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znrf2Q71FD5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znrf2Q71FD5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znrf2Q71FD5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Znrf2Q71FD5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znrf2Q71FD5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znrf2Q71FD5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znrf2Q71FD5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znrf2Q71FD5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Znrf2Q71FD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znrf2Q71FD5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znrf2Q71FD5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znrf2Q71FD5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znrf2Q71FD5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znrf2Q71FD5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znrf2Q71FD5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znrf2Q71FD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znrf2Q71FD5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znrf2Q71FD5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znrf2Q71FD5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znrf2Q71FD5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znrf2Q71FD5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Znrf2Q71FD5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znrf2Q71FD5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znrf2Q71FD5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znrf2Q71FD5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Znrf2Q71FD5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf2Q71FD5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf2Q71FD5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Znrf2Q71FD5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Znrf2Q71FD5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Znrf2Q71FD5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf2Q71FD5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf2Q71FD5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Znrf2Q71FD5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Znrf2Q71FD5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf2Q71FD5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf2Q71FD5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znrf2Q71FD5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf2Q71FD5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf2Q71FD5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf2Q71FD5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znrf2Q71FD5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znrf2Q71FD5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znrf2Q71FD5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znrf2Q71FD5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znrf2Q71FD5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Znrf2Q71FD5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znrf2Q71FD5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znrf2Q71FD5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znrf2Q71FD5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znrf2Q71FD5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znrf2Q71FD5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znrf2Q71FD5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znrf2Q71FD5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znrf2Q71FD5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znrf2Q71FD5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znrf2Q71FD5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znrf2Q71FD5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znrf2Q71FD5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znrf2Q71FD5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znrf2Q71FD5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znrf2Q71FD5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znrf2Q71FD5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Znrf2Q71FD5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms