Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shc4Q6S5L9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shc4Q6S5L9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shc4Q6S5L9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shc4Q6S5L9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Shc4Q6S5L9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shc4Q6S5L9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shc4Q6S5L9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shc4Q6S5L9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shc4Q6S5L9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Shc4Q6S5L9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Shc4Q6S5L9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shc4Q6S5L9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shc4Q6S5L9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Shc4Q6S5L9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shc4Q6S5L9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shc4Q6S5L9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shc4Q6S5L9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Shc4Q6S5L9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shc4Q6S5L9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shc4Q6S5L9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shc4Q6S5L9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shc4Q6S5L9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shc4Q6S5L9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Shc4Q6S5L9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shc4Q6S5L9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shc4Q6S5L9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shc4Q6S5L9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Shc4Q6S5L9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shc4Q6S5L9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Shc4Q6S5L9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shc4Q6S5L9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shc4Q6S5L9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shc4Q6S5L9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shc4Q6S5L9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shc4Q6S5L9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shc4Q6S5L9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shc4Q6S5L9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shc4Q6S5L9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shc4Q6S5L9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Shc4Q6S5L9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shc4Q6S5L9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shc4Q6S5L9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shc4Q6S5L9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Shc4Q6S5L9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shc4Q6S5L9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shc4Q6S5L9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shc4Q6S5L9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shc4Q6S5L9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Shc4Q6S5L9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shc4Q6S5L9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shc4Q6S5L9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shc4Q6S5L9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shc4Q6S5L9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Shc4Q6S5L9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shc4Q6S5L9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shc4Q6S5L9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shc4Q6S5L9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shc4Q6S5L9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Shc4Q6S5L9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Shc4Q6S5L9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shc4Q6S5L9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shc4Q6S5L9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shc4Q6S5L9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shc4Q6S5L9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shc4Q6S5L9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shc4Q6S5L9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shc4Q6S5L9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Shc4Q6S5L9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shc4Q6S5L9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shc4Q6S5L9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Shc4Q6S5L9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shc4Q6S5L9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shc4Q6S5L9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shc4Q6S5L9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shc4Q6S5L9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shc4Q6S5L9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Shc4Q6S5L9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Shc4Q6S5L9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shc4Q6S5L9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shc4Q6S5L9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shc4Q6S5L9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shc4Q6S5L9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shc4Q6S5L9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Shc4Q6S5L9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shc4Q6S5L9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shc4Q6S5L9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Shc4Q6S5L9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms