Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Srsf1Q6PDM2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srsf1Q6PDM2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srsf1Q6PDM2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Srsf1Q6PDM2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Srsf1Q6PDM2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Srsf1Q6PDM2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Srsf1Q6PDM2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srsf1Q6PDM2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srsf1Q6PDM2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Srsf1Q6PDM2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Srsf1Q6PDM2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srsf1Q6PDM2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Srsf1Q6PDM2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srsf1Q6PDM2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Srsf1Q6PDM2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Srsf1Q6PDM2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srsf1Q6PDM2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Srsf1Q6PDM2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srsf1Q6PDM2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Srsf1Q6PDM2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srsf1Q6PDM2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srsf1Q6PDM2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Srsf1Q6PDM2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srsf1Q6PDM2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srsf1Q6PDM2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srsf1Q6PDM2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srsf1Q6PDM2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srsf1Q6PDM2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srsf1Q6PDM2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srsf1Q6PDM2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srsf1Q6PDM2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srsf1Q6PDM2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srsf1Q6PDM2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srsf1Q6PDM2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srsf1Q6PDM2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srsf1Q6PDM2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srsf1Q6PDM2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srsf1Q6PDM2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srsf1Q6PDM2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srsf1Q6PDM2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srsf1Q6PDM2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srsf1Q6PDM2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srsf1Q6PDM2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srsf1Q6PDM2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Srsf1Q6PDM2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srsf1Q6PDM2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Srsf1Q6PDM2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srsf1Q6PDM2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Srsf1Q6PDM2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srsf1Q6PDM2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srsf1Q6PDM2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srsf1Q6PDM2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srsf1Q6PDM2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srsf1Q6PDM2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srsf1Q6PDM2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Srsf1Q6PDM2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srsf1Q6PDM2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Srsf1Q6PDM2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srsf1Q6PDM2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srsf1Q6PDM2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srsf1Q6PDM2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srsf1Q6PDM2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srsf1Q6PDM2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srsf1Q6PDM2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srsf1Q6PDM2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf1Q6PDM2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf1Q6PDM2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf1Q6PDM2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srsf1Q6PDM2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srsf1Q6PDM2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srsf1Q6PDM2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Srsf1Q6PDM2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf1Q6PDM2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Srsf1Q6PDM2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srsf1Q6PDM2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srsf1Q6PDM2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srsf1Q6PDM2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srsf1Q6PDM2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srsf1Q6PDM2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Srsf1Q6PDM2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srsf1Q6PDM2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srsf1Q6PDM2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srsf1Q6PDM2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srsf1Q6PDM2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srsf1Q6PDM2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srsf1Q6PDM2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srsf1Q6PDM2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srsf1Q6PDM2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srsf1Q6PDM2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srsf1Q6PDM2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srsf1Q6PDM2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srsf1Q6PDM2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srsf1Q6PDM2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srsf1Q6PDM2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srsf1Q6PDM2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srsf1Q6PDM2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srsf1Q6PDM2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srsf1Q6PDM2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Srsf1Q6PDM2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms