Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PcnpQ6P8I4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PcnpQ6P8I4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PcnpQ6P8I4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PcnpQ6P8I4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PcnpQ6P8I4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PcnpQ6P8I4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PcnpQ6P8I4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PcnpQ6P8I4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PcnpQ6P8I4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PcnpQ6P8I4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PcnpQ6P8I4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PcnpQ6P8I4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PcnpQ6P8I4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PcnpQ6P8I4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PcnpQ6P8I4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PcnpQ6P8I4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PcnpQ6P8I4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PcnpQ6P8I4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PcnpQ6P8I4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PcnpQ6P8I4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PcnpQ6P8I4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PcnpQ6P8I4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcnpQ6P8I4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcnpQ6P8I4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PcnpQ6P8I4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PcnpQ6P8I4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PcnpQ6P8I4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcnpQ6P8I4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PcnpQ6P8I4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PcnpQ6P8I4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PcnpQ6P8I4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PcnpQ6P8I4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PcnpQ6P8I4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PcnpQ6P8I4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PcnpQ6P8I4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PcnpQ6P8I4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PcnpQ6P8I4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PcnpQ6P8I4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcnpQ6P8I4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcnpQ6P8I4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcnpQ6P8I4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PcnpQ6P8I4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PcnpQ6P8I4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcnpQ6P8I4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PcnpQ6P8I4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcnpQ6P8I4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcnpQ6P8I4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PcnpQ6P8I4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PcnpQ6P8I4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PcnpQ6P8I4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PcnpQ6P8I4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PcnpQ6P8I4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PcnpQ6P8I4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PcnpQ6P8I4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PcnpQ6P8I4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PcnpQ6P8I4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcnpQ6P8I4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcnpQ6P8I4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcnpQ6P8I4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcnpQ6P8I4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PcnpQ6P8I4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PcnpQ6P8I4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PcnpQ6P8I4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PcnpQ6P8I4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PcnpQ6P8I4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PcnpQ6P8I4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PcnpQ6P8I4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms