Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frem2Q6NVD0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frem2Q6NVD0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frem2Q6NVD0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Frem2Q6NVD0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Frem2Q6NVD0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Frem2Q6NVD0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frem2Q6NVD0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frem2Q6NVD0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Frem2Q6NVD0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frem2Q6NVD0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frem2Q6NVD0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frem2Q6NVD0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frem2Q6NVD0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frem2Q6NVD0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frem2Q6NVD0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frem2Q6NVD0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frem2Q6NVD0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frem2Q6NVD0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Frem2Q6NVD0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Frem2Q6NVD0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frem2Q6NVD0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Frem2Q6NVD0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frem2Q6NVD0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frem2Q6NVD0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frem2Q6NVD0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frem2Q6NVD0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Frem2Q6NVD0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frem2Q6NVD0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frem2Q6NVD0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frem2Q6NVD0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Frem2Q6NVD0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frem2Q6NVD0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frem2Q6NVD0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Frem2Q6NVD0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frem2Q6NVD0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frem2Q6NVD0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frem2Q6NVD0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frem2Q6NVD0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frem2Q6NVD0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frem2Q6NVD0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frem2Q6NVD0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frem2Q6NVD0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frem2Q6NVD0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Frem2Q6NVD0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Frem2Q6NVD0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Frem2Q6NVD0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frem2Q6NVD0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Frem2Q6NVD0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Frem2Q6NVD0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frem2Q6NVD0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Frem2Q6NVD0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frem2Q6NVD0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Frem2Q6NVD0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frem2Q6NVD0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frem2Q6NVD0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Frem2Q6NVD0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frem2Q6NVD0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Frem2Q6NVD0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frem2Q6NVD0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Frem2Q6NVD0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frem2Q6NVD0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frem2Q6NVD0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frem2Q6NVD0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frem2Q6NVD0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Frem2Q6NVD0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Frem2Q6NVD0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frem2Q6NVD0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Frem2Q6NVD0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frem2Q6NVD0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Frem2Q6NVD0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Frem2Q6NVD0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Frem2Q6NVD0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Frem2Q6NVD0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frem2Q6NVD0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frem2Q6NVD0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frem2Q6NVD0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frem2Q6NVD0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frem2Q6NVD0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Frem2Q6NVD0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frem2Q6NVD0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Frem2Q6NVD0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frem2Q6NVD0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frem2Q6NVD0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frem2Q6NVD0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frem2Q6NVD0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frem2Q6NVD0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frem2Q6NVD0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frem2Q6NVD0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Frem2Q6NVD0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frem2Q6NVD0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frem2Q6NVD0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frem2Q6NVD0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frem2Q6NVD0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Frem2Q6NVD0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Frem2Q6NVD0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frem2Q6NVD0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frem2Q6NVD0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frem2Q6NVD0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frem2Q6NVD0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms