Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NipblQ6KCD5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NipblQ6KCD5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NipblQ6KCD5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NipblQ6KCD5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NipblQ6KCD5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NipblQ6KCD5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NipblQ6KCD5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NipblQ6KCD5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NipblQ6KCD5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NipblQ6KCD5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NipblQ6KCD5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NipblQ6KCD5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NipblQ6KCD5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NipblQ6KCD5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NipblQ6KCD5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NipblQ6KCD5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NipblQ6KCD5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NipblQ6KCD5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NipblQ6KCD5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NipblQ6KCD5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NipblQ6KCD5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NipblQ6KCD5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NipblQ6KCD5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NipblQ6KCD5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NipblQ6KCD5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NipblQ6KCD5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NipblQ6KCD5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NipblQ6KCD5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NipblQ6KCD5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NipblQ6KCD5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NipblQ6KCD5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms