Protein–RNA interactions for Protein: Q64FW2

Retsat, All-trans-retinol 13,14-reductase, mousemouse

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetsatQ64FW2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RetsatQ64FW2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RetsatQ64FW2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RetsatQ64FW2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RetsatQ64FW2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RetsatQ64FW2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RetsatQ64FW2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RetsatQ64FW2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RetsatQ64FW2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RetsatQ64FW2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RetsatQ64FW2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RetsatQ64FW2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RetsatQ64FW2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RetsatQ64FW2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RetsatQ64FW2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RetsatQ64FW2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RetsatQ64FW2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RetsatQ64FW2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RetsatQ64FW2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RetsatQ64FW2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RetsatQ64FW2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RetsatQ64FW2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RetsatQ64FW2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RetsatQ64FW2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RetsatQ64FW2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RetsatQ64FW2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RetsatQ64FW2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RetsatQ64FW2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RetsatQ64FW2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RetsatQ64FW2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RetsatQ64FW2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RetsatQ64FW2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RetsatQ64FW2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RetsatQ64FW2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RetsatQ64FW2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RetsatQ64FW2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RetsatQ64FW2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RetsatQ64FW2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RetsatQ64FW2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RetsatQ64FW2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RetsatQ64FW2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RetsatQ64FW2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RetsatQ64FW2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RetsatQ64FW2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RetsatQ64FW2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RetsatQ64FW2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RetsatQ64FW2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RetsatQ64FW2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RetsatQ64FW2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RetsatQ64FW2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RetsatQ64FW2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RetsatQ64FW2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RetsatQ64FW2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RetsatQ64FW2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RetsatQ64FW2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RetsatQ64FW2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RetsatQ64FW2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RetsatQ64FW2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RetsatQ64FW2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RetsatQ64FW2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RetsatQ64FW2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RetsatQ64FW2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RetsatQ64FW2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RetsatQ64FW2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RetsatQ64FW2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RetsatQ64FW2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RetsatQ64FW2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RetsatQ64FW2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RetsatQ64FW2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RetsatQ64FW2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RetsatQ64FW2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RetsatQ64FW2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RetsatQ64FW2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RetsatQ64FW2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RetsatQ64FW2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RetsatQ64FW2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RetsatQ64FW2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RetsatQ64FW2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RetsatQ64FW2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RetsatQ64FW2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RetsatQ64FW2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RetsatQ64FW2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RetsatQ64FW2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RetsatQ64FW2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RetsatQ64FW2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RetsatQ64FW2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RetsatQ64FW2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RetsatQ64FW2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RetsatQ64FW2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RetsatQ64FW2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RetsatQ64FW2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RetsatQ64FW2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RetsatQ64FW2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RetsatQ64FW2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RetsatQ64FW2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RetsatQ64FW2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RetsatQ64FW2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RetsatQ64FW2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RetsatQ64FW2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RetsatQ64FW2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms