Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PtprdQ64487 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PtprdQ64487 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprdQ64487 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PtprdQ64487 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprdQ64487 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprdQ64487 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PtprdQ64487 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprdQ64487 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprdQ64487 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprdQ64487 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprdQ64487 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprdQ64487 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprdQ64487 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PtprdQ64487 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprdQ64487 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PtprdQ64487 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PtprdQ64487 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PtprdQ64487 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprdQ64487 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PtprdQ64487 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprdQ64487 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PtprdQ64487 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PtprdQ64487 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprdQ64487 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PtprdQ64487 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprdQ64487 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprdQ64487 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprdQ64487 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprdQ64487 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprdQ64487 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprdQ64487 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprdQ64487 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprdQ64487 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprdQ64487 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprdQ64487 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprdQ64487 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprdQ64487 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprdQ64487 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprdQ64487 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprdQ64487 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprdQ64487 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprdQ64487 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PtprdQ64487 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprdQ64487 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PtprdQ64487 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PtprdQ64487 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PtprdQ64487 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PtprdQ64487 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprdQ64487 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprdQ64487 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PtprdQ64487 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PtprdQ64487 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprdQ64487 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprdQ64487 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprdQ64487 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprdQ64487 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprdQ64487 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprdQ64487 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprdQ64487 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprdQ64487 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprdQ64487 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprdQ64487 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprdQ64487 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprdQ64487 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprdQ64487 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprdQ64487 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprdQ64487 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprdQ64487 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprdQ64487 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprdQ64487 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprdQ64487 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprdQ64487 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprdQ64487 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprdQ64487 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprdQ64487 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprdQ64487 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprdQ64487 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprdQ64487 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms