Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TrhQ62361 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TrhQ62361 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TrhQ62361 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TrhQ62361 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TrhQ62361 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TrhQ62361 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TrhQ62361 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TrhQ62361 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TrhQ62361 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TrhQ62361 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TrhQ62361 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TrhQ62361 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TrhQ62361 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TrhQ62361 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TrhQ62361 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TrhQ62361 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TrhQ62361 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TrhQ62361 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TrhQ62361 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TrhQ62361 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TrhQ62361 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TrhQ62361 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TrhQ62361 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
TrhQ62361 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TrhQ62361 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TrhQ62361 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TrhQ62361 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TrhQ62361 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TrhQ62361 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TrhQ62361 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TrhQ62361 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TrhQ62361 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TrhQ62361 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TrhQ62361 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TrhQ62361 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TrhQ62361 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TrhQ62361 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TrhQ62361 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TrhQ62361 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TrhQ62361 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TrhQ62361 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TrhQ62361 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TrhQ62361 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TrhQ62361 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TrhQ62361 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TrhQ62361 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TrhQ62361 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TrhQ62361 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TrhQ62361 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TrhQ62361 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TrhQ62361 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TrhQ62361 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TrhQ62361 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TrhQ62361 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TrhQ62361 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TrhQ62361 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TrhQ62361 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TrhQ62361 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TrhQ62361 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TrhQ62361 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TrhQ62361 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TrhQ62361 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TrhQ62361 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TrhQ62361 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TrhQ62361 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
TrhQ62361 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TrhQ62361 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TrhQ62361 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TrhQ62361 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TrhQ62361 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TrhQ62361 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TrhQ62361 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TrhQ62361 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TrhQ62361 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
TrhQ62361 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TrhQ62361 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TrhQ62361 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TrhQ62361 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TrhQ62361 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TrhQ62361 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TrhQ62361 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TrhQ62361 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TrhQ62361 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TrhQ62361 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TrhQ62361 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TrhQ62361 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TrhQ62361 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TrhQ62361 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TrhQ62361 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TrhQ62361 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TrhQ62361 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TrhQ62361 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TrhQ62361 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TrhQ62361 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TrhQ62361 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TrhQ62361 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TrhQ62361 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TrhQ62361 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TrhQ62361 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms