Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sptbn1Q62261 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptbn1Q62261 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sptbn1Q62261 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sptbn1Q62261 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sptbn1Q62261 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sptbn1Q62261 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sptbn1Q62261 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn1Q62261 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn1Q62261 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sptbn1Q62261 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn1Q62261 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sptbn1Q62261 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn1Q62261 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn1Q62261 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sptbn1Q62261 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn1Q62261 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sptbn1Q62261 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn1Q62261 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sptbn1Q62261 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sptbn1Q62261 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptbn1Q62261 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sptbn1Q62261 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sptbn1Q62261 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sptbn1Q62261 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn1Q62261 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn1Q62261 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sptbn1Q62261 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sptbn1Q62261 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn1Q62261 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sptbn1Q62261 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn1Q62261 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sptbn1Q62261 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptbn1Q62261 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptbn1Q62261 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptbn1Q62261 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn1Q62261 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptbn1Q62261 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptbn1Q62261 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptbn1Q62261 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn1Q62261 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptbn1Q62261 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptbn1Q62261 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptbn1Q62261 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn1Q62261 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptbn1Q62261 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptbn1Q62261 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptbn1Q62261 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sptbn1Q62261 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn1Q62261 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn1Q62261 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sptbn1Q62261 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sptbn1Q62261 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn1Q62261 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sptbn1Q62261 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sptbn1Q62261 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sptbn1Q62261 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sptbn1Q62261 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn1Q62261 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sptbn1Q62261 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptbn1Q62261 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn1Q62261 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn1Q62261 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn1Q62261 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptbn1Q62261 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptbn1Q62261 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptbn1Q62261 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn1Q62261 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptbn1Q62261 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn1Q62261 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptbn1Q62261 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn1Q62261 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sptbn1Q62261 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sptbn1Q62261 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptbn1Q62261 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptbn1Q62261 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn1Q62261 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn1Q62261 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptbn1Q62261 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn1Q62261 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn1Q62261 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn1Q62261 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn1Q62261 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn1Q62261 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn1Q62261 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn1Q62261 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn1Q62261 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn1Q62261 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn1Q62261 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn1Q62261 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn1Q62261 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn1Q62261 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn1Q62261 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn1Q62261 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn1Q62261 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn1Q62261 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn1Q62261 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn1Q62261 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn1Q62261 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn1Q62261 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms