Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lama3Q61789 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Lama3Q61789 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lama3Q61789 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lama3Q61789 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lama3Q61789 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lama3Q61789 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lama3Q61789 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lama3Q61789 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lama3Q61789 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lama3Q61789 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lama3Q61789 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lama3Q61789 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lama3Q61789 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lama3Q61789 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Lama3Q61789 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lama3Q61789 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Lama3Q61789 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lama3Q61789 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lama3Q61789 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lama3Q61789 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lama3Q61789 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lama3Q61789 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lama3Q61789 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lama3Q61789 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lama3Q61789 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lama3Q61789 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lama3Q61789 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lama3Q61789 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lama3Q61789 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Lama3Q61789 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lama3Q61789 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lama3Q61789 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lama3Q61789 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lama3Q61789 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lama3Q61789 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lama3Q61789 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lama3Q61789 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Lama3Q61789 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Lama3Q61789 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lama3Q61789 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lama3Q61789 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Lama3Q61789 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lama3Q61789 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lama3Q61789 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lama3Q61789 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lama3Q61789 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lama3Q61789 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lama3Q61789 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Lama3Q61789 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lama3Q61789 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lama3Q61789 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Lama3Q61789 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Lama3Q61789 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Lama3Q61789 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lama3Q61789 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Lama3Q61789 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Lama3Q61789 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lama3Q61789 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lama3Q61789 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lama3Q61789 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lama3Q61789 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lama3Q61789 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lama3Q61789 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lama3Q61789 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lama3Q61789 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lama3Q61789 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Lama3Q61789 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lama3Q61789 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lama3Q61789 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lama3Q61789 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lama3Q61789 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lama3Q61789 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lama3Q61789 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lama3Q61789 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lama3Q61789 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lama3Q61789 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lama3Q61789 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lama3Q61789 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lama3Q61789 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lama3Q61789 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lama3Q61789 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lama3Q61789 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lama3Q61789 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lama3Q61789 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lama3Q61789 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lama3Q61789 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lama3Q61789 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lama3Q61789 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lama3Q61789 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lama3Q61789 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lama3Q61789 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lama3Q61789 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lama3Q61789 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lama3Q61789 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lama3Q61789 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lama3Q61789 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lama3Q61789 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lama3Q61789 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lama3Q61789 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms