Protein–RNA interactions for Protein: Q60716

P4ha2, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha2Q60716 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4ha2Q60716 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4ha2Q60716 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P4ha2Q60716 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P4ha2Q60716 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P4ha2Q60716 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4ha2Q60716 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P4ha2Q60716 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
P4ha2Q60716 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
P4ha2Q60716 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P4ha2Q60716 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P4ha2Q60716 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P4ha2Q60716 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha2Q60716 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P4ha2Q60716 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4ha2Q60716 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
P4ha2Q60716 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P4ha2Q60716 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P4ha2Q60716 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
P4ha2Q60716 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4ha2Q60716 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4ha2Q60716 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P4ha2Q60716 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4ha2Q60716 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P4ha2Q60716 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4ha2Q60716 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
P4ha2Q60716 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P4ha2Q60716 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4ha2Q60716 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P4ha2Q60716 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P4ha2Q60716 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P4ha2Q60716 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P4ha2Q60716 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P4ha2Q60716 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha2Q60716 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha2Q60716 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P4ha2Q60716 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P4ha2Q60716 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P4ha2Q60716 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
P4ha2Q60716 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P4ha2Q60716 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P4ha2Q60716 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P4ha2Q60716 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P4ha2Q60716 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P4ha2Q60716 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P4ha2Q60716 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P4ha2Q60716 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P4ha2Q60716 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P4ha2Q60716 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P4ha2Q60716 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P4ha2Q60716 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P4ha2Q60716 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
P4ha2Q60716 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P4ha2Q60716 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P4ha2Q60716 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P4ha2Q60716 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P4ha2Q60716 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P4ha2Q60716 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P4ha2Q60716 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P4ha2Q60716 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P4ha2Q60716 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P4ha2Q60716 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P4ha2Q60716 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
P4ha2Q60716 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4ha2Q60716 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4ha2Q60716 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P4ha2Q60716 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
P4ha2Q60716 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
P4ha2Q60716 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
P4ha2Q60716 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
P4ha2Q60716 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P4ha2Q60716 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P4ha2Q60716 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
P4ha2Q60716 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
P4ha2Q60716 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
P4ha2Q60716 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
P4ha2Q60716 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P4ha2Q60716 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P4ha2Q60716 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P4ha2Q60716 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
P4ha2Q60716 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
P4ha2Q60716 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P4ha2Q60716 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P4ha2Q60716 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
P4ha2Q60716 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P4ha2Q60716 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P4ha2Q60716 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P4ha2Q60716 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms