Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm2aQ60648 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2aQ60648 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2aQ60648 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2aQ60648 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2aQ60648 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2aQ60648 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm2aQ60648 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2aQ60648 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2aQ60648 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2aQ60648 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2aQ60648 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2aQ60648 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2aQ60648 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2aQ60648 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2aQ60648 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2aQ60648 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2aQ60648 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2aQ60648 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2aQ60648 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2aQ60648 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm2aQ60648 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm2aQ60648 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm2aQ60648 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm2aQ60648 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm2aQ60648 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm2aQ60648 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm2aQ60648 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm2aQ60648 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm2aQ60648 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm2aQ60648 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2aQ60648 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2aQ60648 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2aQ60648 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2aQ60648 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2aQ60648 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm2aQ60648 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2aQ60648 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2aQ60648 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2aQ60648 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2aQ60648 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2aQ60648 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2aQ60648 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2aQ60648 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2aQ60648 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2aQ60648 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2aQ60648 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm2aQ60648 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2aQ60648 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2aQ60648 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2aQ60648 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2aQ60648 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm2aQ60648 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm2aQ60648 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm2aQ60648 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2aQ60648 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2aQ60648 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm2aQ60648 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm2aQ60648 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm2aQ60648 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm2aQ60648 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm2aQ60648 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm2aQ60648 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2aQ60648 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm2aQ60648 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2aQ60648 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm2aQ60648 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm2aQ60648 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2aQ60648 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm2aQ60648 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm2aQ60648 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2aQ60648 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm2aQ60648 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm2aQ60648 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm2aQ60648 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2aQ60648 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2aQ60648 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm2aQ60648 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2aQ60648 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2aQ60648 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2aQ60648 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2aQ60648 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm2aQ60648 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm2aQ60648 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm2aQ60648 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2aQ60648 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm2aQ60648 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms