Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Mks1Q5SW45 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Mks1Q5SW45 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mks1Q5SW45 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mks1Q5SW45 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mks1Q5SW45 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mks1Q5SW45 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mks1Q5SW45 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Mks1Q5SW45 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mks1Q5SW45 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mks1Q5SW45 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mks1Q5SW45 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Mks1Q5SW45 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Mks1Q5SW45 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mks1Q5SW45 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mks1Q5SW45 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mks1Q5SW45 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mks1Q5SW45 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mks1Q5SW45 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mks1Q5SW45 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mks1Q5SW45 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mks1Q5SW45 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mks1Q5SW45 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mks1Q5SW45 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mks1Q5SW45 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mks1Q5SW45 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mks1Q5SW45 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mks1Q5SW45 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mks1Q5SW45 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mks1Q5SW45 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mks1Q5SW45 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mks1Q5SW45 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mks1Q5SW45 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mks1Q5SW45 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mks1Q5SW45 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mks1Q5SW45 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mks1Q5SW45 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mks1Q5SW45 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mks1Q5SW45 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mks1Q5SW45 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mks1Q5SW45 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mks1Q5SW45 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mks1Q5SW45 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mks1Q5SW45 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mks1Q5SW45 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mks1Q5SW45 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mks1Q5SW45 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mks1Q5SW45 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mks1Q5SW45 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mks1Q5SW45 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mks1Q5SW45 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mks1Q5SW45 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mks1Q5SW45 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mks1Q5SW45 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Mks1Q5SW45 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mks1Q5SW45 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mks1Q5SW45 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mks1Q5SW45 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mks1Q5SW45 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mks1Q5SW45 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mks1Q5SW45 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mks1Q5SW45 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mks1Q5SW45 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mks1Q5SW45 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mks1Q5SW45 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mks1Q5SW45 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mks1Q5SW45 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mks1Q5SW45 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mks1Q5SW45 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mks1Q5SW45 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mks1Q5SW45 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mks1Q5SW45 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mks1Q5SW45 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mks1Q5SW45 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mks1Q5SW45 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Mks1Q5SW45 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mks1Q5SW45 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mks1Q5SW45 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mks1Q5SW45 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mks1Q5SW45 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mks1Q5SW45 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mks1Q5SW45 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mks1Q5SW45 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mks1Q5SW45 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mks1Q5SW45 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mks1Q5SW45 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mks1Q5SW45 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms