Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fbxo39Q5NBU5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fbxo39Q5NBU5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Fbxo39Q5NBU5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fbxo39Q5NBU5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fbxo39Q5NBU5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fbxo39Q5NBU5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fbxo39Q5NBU5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fbxo39Q5NBU5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fbxo39Q5NBU5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fbxo39Q5NBU5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fbxo39Q5NBU5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fbxo39Q5NBU5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Fbxo39Q5NBU5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fbxo39Q5NBU5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fbxo39Q5NBU5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fbxo39Q5NBU5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fbxo39Q5NBU5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fbxo39Q5NBU5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fbxo39Q5NBU5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fbxo39Q5NBU5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fbxo39Q5NBU5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fbxo39Q5NBU5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fbxo39Q5NBU5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fbxo39Q5NBU5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fbxo39Q5NBU5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fbxo39Q5NBU5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fbxo39Q5NBU5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fbxo39Q5NBU5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fbxo39Q5NBU5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fbxo39Q5NBU5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Fbxo39Q5NBU5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Fbxo39Q5NBU5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fbxo39Q5NBU5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Fbxo39Q5NBU5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fbxo39Q5NBU5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fbxo39Q5NBU5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fbxo39Q5NBU5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fbxo39Q5NBU5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fbxo39Q5NBU5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fbxo39Q5NBU5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Fbxo39Q5NBU5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbxo39Q5NBU5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fbxo39Q5NBU5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fbxo39Q5NBU5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fbxo39Q5NBU5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fbxo39Q5NBU5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fbxo39Q5NBU5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fbxo39Q5NBU5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fbxo39Q5NBU5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fbxo39Q5NBU5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fbxo39Q5NBU5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fbxo39Q5NBU5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fbxo39Q5NBU5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fbxo39Q5NBU5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fbxo39Q5NBU5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fbxo39Q5NBU5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fbxo39Q5NBU5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Fbxo39Q5NBU5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fbxo39Q5NBU5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fbxo39Q5NBU5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fbxo39Q5NBU5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fbxo39Q5NBU5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fbxo39Q5NBU5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fbxo39Q5NBU5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Fbxo39Q5NBU5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fbxo39Q5NBU5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbxo39Q5NBU5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbxo39Q5NBU5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbxo39Q5NBU5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fbxo39Q5NBU5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fbxo39Q5NBU5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fbxo39Q5NBU5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fbxo39Q5NBU5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fbxo39Q5NBU5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fbxo39Q5NBU5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fbxo39Q5NBU5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fbxo39Q5NBU5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fbxo39Q5NBU5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fbxo39Q5NBU5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fbxo39Q5NBU5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fbxo39Q5NBU5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fbxo39Q5NBU5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms