Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Taf3Q5HZG4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Taf3Q5HZG4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Taf3Q5HZG4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Taf3Q5HZG4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Taf3Q5HZG4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Taf3Q5HZG4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Taf3Q5HZG4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Taf3Q5HZG4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Taf3Q5HZG4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Taf3Q5HZG4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Taf3Q5HZG4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Taf3Q5HZG4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Taf3Q5HZG4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Taf3Q5HZG4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Taf3Q5HZG4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Taf3Q5HZG4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Taf3Q5HZG4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Taf3Q5HZG4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Taf3Q5HZG4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Taf3Q5HZG4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Taf3Q5HZG4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Taf3Q5HZG4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Taf3Q5HZG4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Taf3Q5HZG4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Taf3Q5HZG4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Taf3Q5HZG4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Taf3Q5HZG4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Taf3Q5HZG4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Taf3Q5HZG4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Taf3Q5HZG4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Taf3Q5HZG4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Taf3Q5HZG4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Taf3Q5HZG4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Taf3Q5HZG4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Taf3Q5HZG4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Taf3Q5HZG4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Taf3Q5HZG4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Taf3Q5HZG4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Taf3Q5HZG4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Taf3Q5HZG4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Taf3Q5HZG4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Taf3Q5HZG4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Taf3Q5HZG4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Taf3Q5HZG4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Taf3Q5HZG4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Taf3Q5HZG4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Taf3Q5HZG4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Taf3Q5HZG4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf3Q5HZG4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf3Q5HZG4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf3Q5HZG4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Taf3Q5HZG4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Taf3Q5HZG4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Taf3Q5HZG4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Taf3Q5HZG4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Taf3Q5HZG4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Taf3Q5HZG4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Taf3Q5HZG4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Taf3Q5HZG4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Taf3Q5HZG4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Taf3Q5HZG4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Taf3Q5HZG4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Taf3Q5HZG4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Taf3Q5HZG4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Taf3Q5HZG4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Taf3Q5HZG4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Taf3Q5HZG4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Taf3Q5HZG4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Taf3Q5HZG4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Taf3Q5HZG4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Taf3Q5HZG4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Taf3Q5HZG4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Taf3Q5HZG4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Taf3Q5HZG4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Taf3Q5HZG4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Taf3Q5HZG4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Taf3Q5HZG4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Taf3Q5HZG4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Taf3Q5HZG4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Taf3Q5HZG4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Taf3Q5HZG4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Taf3Q5HZG4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Taf3Q5HZG4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Taf3Q5HZG4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Taf3Q5HZG4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Taf3Q5HZG4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Taf3Q5HZG4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf3Q5HZG4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Taf3Q5HZG4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Taf3Q5HZG4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Taf3Q5HZG4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Taf3Q5HZG4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Taf3Q5HZG4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Taf3Q5HZG4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Taf3Q5HZG4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Taf3Q5HZG4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Taf3Q5HZG4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Taf3Q5HZG4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Taf3Q5HZG4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms