Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q5EBG8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q5EBG8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Q5EBG8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Q5EBG8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q5EBG8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q5EBG8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q5EBG8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q5EBG8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q5EBG8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q5EBG8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q5EBG8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q5EBG8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q5EBG8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q5EBG8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q5EBG8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q5EBG8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q5EBG8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q5EBG8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q5EBG8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q5EBG8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q5EBG8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q5EBG8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q5EBG8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q5EBG8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q5EBG8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q5EBG8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q5EBG8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q5EBG8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q5EBG8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q5EBG8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q5EBG8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q5EBG8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q5EBG8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q5EBG8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q5EBG8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q5EBG8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q5EBG8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q5EBG8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q5EBG8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q5EBG8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q5EBG8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q5EBG8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q5EBG8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q5EBG8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q5EBG8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q5EBG8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Q5EBG8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q5EBG8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q5EBG8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q5EBG8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q5EBG8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Q5EBG8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q5EBG8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q5EBG8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q5EBG8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q5EBG8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q5EBG8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q5EBG8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q5EBG8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q5EBG8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q5EBG8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q5EBG8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q5EBG8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q5EBG8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q5EBG8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q5EBG8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Q5EBG8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q5EBG8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q5EBG8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q5EBG8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q5EBG8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q5EBG8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q5EBG8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q5EBG8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Q5EBG8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q5EBG8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q5EBG8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q5EBG8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q5EBG8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q5EBG8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q5EBG8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q5EBG8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q5EBG8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q5EBG8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q5EBG8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q5EBG8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms