Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC49.26■■■■■ 5.48
Pds5bQ4VA53 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC49.24■■■■■ 5.47
Pds5bQ4VA53 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
Pds5bQ4VA53 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
Pds5bQ4VA53 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC49.22■■■■■ 5.47
Pds5bQ4VA53 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
Pds5bQ4VA53 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.19■■■■■ 5.47
Pds5bQ4VA53 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
Pds5bQ4VA53 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
Pds5bQ4VA53 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.16■■■■■ 5.46
Pds5bQ4VA53 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.12■■■■■ 5.45
Pds5bQ4VA53 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
Pds5bQ4VA53 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC49.06■■■■■ 5.44
Pds5bQ4VA53 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.04■■■■■ 5.44
Pds5bQ4VA53 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
Pds5bQ4VA53 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC49.01■■■■■ 5.44
Pds5bQ4VA53 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.44
Pds5bQ4VA53 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC48.99■■■■■ 5.43
Pds5bQ4VA53 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.97■■■■■ 5.43
Pds5bQ4VA53 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
Pds5bQ4VA53 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.96■■■■■ 5.43
Pds5bQ4VA53 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
Pds5bQ4VA53 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
Pds5bQ4VA53 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
Pds5bQ4VA53 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC48.92■■■■■ 5.42
Pds5bQ4VA53 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
Pds5bQ4VA53 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
Pds5bQ4VA53 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
Pds5bQ4VA53 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
Pds5bQ4VA53 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC48.8■■■■■ 5.4
Pds5bQ4VA53 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC48.8■■■■■ 5.4
Pds5bQ4VA53 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.38
Pds5bQ4VA53 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
Pds5bQ4VA53 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC48.67■■■■■ 5.38
Pds5bQ4VA53 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC48.67■■■■■ 5.38
Pds5bQ4VA53 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
Pds5bQ4VA53 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
Pds5bQ4VA53 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC48.59■■■■■ 5.37
Pds5bQ4VA53 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC48.58■■■■■ 5.37
Pds5bQ4VA53 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.58■■■■■ 5.37
Pds5bQ4VA53 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC48.56■■■■■ 5.36
Pds5bQ4VA53 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
Pds5bQ4VA53 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC48.43■■■■■ 5.34
Pds5bQ4VA53 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
Pds5bQ4VA53 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
Pds5bQ4VA53 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC48.41■■■■■ 5.34
Pds5bQ4VA53 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.34
Pds5bQ4VA53 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC48.38■■■■■ 5.34
Pds5bQ4VA53 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC48.38■■■■■ 5.34
Pds5bQ4VA53 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC48.37■■■■■ 5.33
Pds5bQ4VA53 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC48.35■■■■■ 5.33
Pds5bQ4VA53 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
Pds5bQ4VA53 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
Pds5bQ4VA53 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC48.27■■■■■ 5.32
Pds5bQ4VA53 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC48.27■■■■■ 5.32
Pds5bQ4VA53 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.27■■■■■ 5.32
Pds5bQ4VA53 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC48.24■■■■■ 5.31
Pds5bQ4VA53 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
Pds5bQ4VA53 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
Pds5bQ4VA53 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
Pds5bQ4VA53 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
Pds5bQ4VA53 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
Pds5bQ4VA53 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
Pds5bQ4VA53 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.07■■■■■ 5.28
Pds5bQ4VA53 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
Pds5bQ4VA53 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC48.05■■■■■ 5.28
Pds5bQ4VA53 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
Pds5bQ4VA53 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
Pds5bQ4VA53 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
Pds5bQ4VA53 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC47.88■■■■■ 5.25
Pds5bQ4VA53 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
Pds5bQ4VA53 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
Pds5bQ4VA53 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
Pds5bQ4VA53 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.8■■■■■ 5.24
Pds5bQ4VA53 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
Pds5bQ4VA53 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.74■■■■■ 5.23
Pds5bQ4VA53 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
Pds5bQ4VA53 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC47.64■■■■■ 5.22
Pds5bQ4VA53 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC47.64■■■■■ 5.22
Pds5bQ4VA53 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
Pds5bQ4VA53 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
Pds5bQ4VA53 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Pds5bQ4VA53 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Pds5bQ4VA53 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
Pds5bQ4VA53 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
Pds5bQ4VA53 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
Pds5bQ4VA53 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC47.55■■■■■ 5.2
Pds5bQ4VA53 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
Pds5bQ4VA53 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Pds5bQ4VA53 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Pds5bQ4VA53 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC47.43■■■■■ 5.18
Pds5bQ4VA53 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC47.41■■■■■ 5.18
Pds5bQ4VA53 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
Pds5bQ4VA53 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC47.33■■■■■ 5.17
Pds5bQ4VA53 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Pds5bQ4VA53 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
Pds5bQ4VA53 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
Pds5bQ4VA53 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
Pds5bQ4VA53 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.24■■■■■ 5.15
Pds5bQ4VA53 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC47.24■■■■■ 5.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms