Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srek1ip1Q4V9W2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srek1ip1Q4V9W2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srek1ip1Q4V9W2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Srek1ip1Q4V9W2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srek1ip1Q4V9W2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srek1ip1Q4V9W2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srek1ip1Q4V9W2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srek1ip1Q4V9W2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Srek1ip1Q4V9W2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Srek1ip1Q4V9W2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srek1ip1Q4V9W2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srek1ip1Q4V9W2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srek1ip1Q4V9W2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srek1ip1Q4V9W2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srek1ip1Q4V9W2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srek1ip1Q4V9W2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srek1ip1Q4V9W2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srek1ip1Q4V9W2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srek1ip1Q4V9W2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srek1ip1Q4V9W2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srek1ip1Q4V9W2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srek1ip1Q4V9W2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srek1ip1Q4V9W2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srek1ip1Q4V9W2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srek1ip1Q4V9W2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srek1ip1Q4V9W2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srek1ip1Q4V9W2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srek1ip1Q4V9W2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srek1ip1Q4V9W2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srek1ip1Q4V9W2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Srek1ip1Q4V9W2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srek1ip1Q4V9W2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srek1ip1Q4V9W2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srek1ip1Q4V9W2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Srek1ip1Q4V9W2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srek1ip1Q4V9W2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srek1ip1Q4V9W2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srek1ip1Q4V9W2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srek1ip1Q4V9W2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Srek1ip1Q4V9W2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srek1ip1Q4V9W2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srek1ip1Q4V9W2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srek1ip1Q4V9W2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srek1ip1Q4V9W2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srek1ip1Q4V9W2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srek1ip1Q4V9W2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srek1ip1Q4V9W2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srek1ip1Q4V9W2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srek1ip1Q4V9W2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srek1ip1Q4V9W2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srek1ip1Q4V9W2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srek1ip1Q4V9W2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srek1ip1Q4V9W2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srek1ip1Q4V9W2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srek1ip1Q4V9W2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms