Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmed1Q3V009 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmed1Q3V009 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmed1Q3V009 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmed1Q3V009 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmed1Q3V009 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmed1Q3V009 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmed1Q3V009 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmed1Q3V009 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmed1Q3V009 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmed1Q3V009 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmed1Q3V009 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmed1Q3V009 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmed1Q3V009 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmed1Q3V009 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmed1Q3V009 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed1Q3V009 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed1Q3V009 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmed1Q3V009 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed1Q3V009 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmed1Q3V009 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmed1Q3V009 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmed1Q3V009 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmed1Q3V009 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmed1Q3V009 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmed1Q3V009 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmed1Q3V009 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmed1Q3V009 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmed1Q3V009 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmed1Q3V009 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmed1Q3V009 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmed1Q3V009 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmed1Q3V009 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmed1Q3V009 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmed1Q3V009 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmed1Q3V009 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmed1Q3V009 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmed1Q3V009 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmed1Q3V009 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmed1Q3V009 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmed1Q3V009 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmed1Q3V009 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmed1Q3V009 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmed1Q3V009 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmed1Q3V009 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmed1Q3V009 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmed1Q3V009 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmed1Q3V009 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmed1Q3V009 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmed1Q3V009 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmed1Q3V009 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmed1Q3V009 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmed1Q3V009 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmed1Q3V009 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmed1Q3V009 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmed1Q3V009 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmed1Q3V009 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmed1Q3V009 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmed1Q3V009 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmed1Q3V009 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmed1Q3V009 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmed1Q3V009 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmed1Q3V009 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmed1Q3V009 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmed1Q3V009 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmed1Q3V009 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmed1Q3V009 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmed1Q3V009 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmed1Q3V009 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmed1Q3V009 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmed1Q3V009 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmed1Q3V009 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmed1Q3V009 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed1Q3V009 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed1Q3V009 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed1Q3V009 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed1Q3V009 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed1Q3V009 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed1Q3V009 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed1Q3V009 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed1Q3V009 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms