Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lrrfip1Q3UZ39 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lrrfip1Q3UZ39 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lrrfip1Q3UZ39 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lrrfip1Q3UZ39 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrfip1Q3UZ39 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrfip1Q3UZ39 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrrfip1Q3UZ39 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrfip1Q3UZ39 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrrfip1Q3UZ39 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrrfip1Q3UZ39 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrrfip1Q3UZ39 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrrfip1Q3UZ39 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrfip1Q3UZ39 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrfip1Q3UZ39 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrrfip1Q3UZ39 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lrrfip1Q3UZ39 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrfip1Q3UZ39 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrfip1Q3UZ39 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrrfip1Q3UZ39 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrrfip1Q3UZ39 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrfip1Q3UZ39 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrrfip1Q3UZ39 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrrfip1Q3UZ39 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrrfip1Q3UZ39 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Lrrfip1Q3UZ39 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrrfip1Q3UZ39 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrrfip1Q3UZ39 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrrfip1Q3UZ39 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrfip1Q3UZ39 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lrrfip1Q3UZ39 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lrrfip1Q3UZ39 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrfip1Q3UZ39 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrfip1Q3UZ39 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrfip1Q3UZ39 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lrrfip1Q3UZ39 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrfip1Q3UZ39 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrfip1Q3UZ39 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lrrfip1Q3UZ39 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lrrfip1Q3UZ39 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lrrfip1Q3UZ39 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lrrfip1Q3UZ39 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrfip1Q3UZ39 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lrrfip1Q3UZ39 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrfip1Q3UZ39 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrfip1Q3UZ39 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrfip1Q3UZ39 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrfip1Q3UZ39 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrfip1Q3UZ39 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrfip1Q3UZ39 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrfip1Q3UZ39 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrfip1Q3UZ39 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrfip1Q3UZ39 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrrfip1Q3UZ39 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrfip1Q3UZ39 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrfip1Q3UZ39 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrfip1Q3UZ39 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrfip1Q3UZ39 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrfip1Q3UZ39 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrfip1Q3UZ39 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrrfip1Q3UZ39 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrrfip1Q3UZ39 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrfip1Q3UZ39 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrrfip1Q3UZ39 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrfip1Q3UZ39 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrfip1Q3UZ39 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrfip1Q3UZ39 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrfip1Q3UZ39 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lrrfip1Q3UZ39 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrfip1Q3UZ39 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lrrfip1Q3UZ39 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrfip1Q3UZ39 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lrrfip1Q3UZ39 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrfip1Q3UZ39 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrfip1Q3UZ39 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lrrfip1Q3UZ39 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrfip1Q3UZ39 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Lrrfip1Q3UZ39 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms