Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTH8

Arhgef9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef9Q3UTH8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arhgef9Q3UTH8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arhgef9Q3UTH8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arhgef9Q3UTH8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgef9Q3UTH8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arhgef9Q3UTH8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arhgef9Q3UTH8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgef9Q3UTH8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arhgef9Q3UTH8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arhgef9Q3UTH8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arhgef9Q3UTH8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgef9Q3UTH8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arhgef9Q3UTH8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgef9Q3UTH8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arhgef9Q3UTH8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Arhgef9Q3UTH8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Arhgef9Q3UTH8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arhgef9Q3UTH8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arhgef9Q3UTH8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arhgef9Q3UTH8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Arhgef9Q3UTH8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arhgef9Q3UTH8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arhgef9Q3UTH8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgef9Q3UTH8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arhgef9Q3UTH8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgef9Q3UTH8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arhgef9Q3UTH8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arhgef9Q3UTH8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arhgef9Q3UTH8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arhgef9Q3UTH8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arhgef9Q3UTH8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arhgef9Q3UTH8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgef9Q3UTH8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arhgef9Q3UTH8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arhgef9Q3UTH8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgef9Q3UTH8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arhgef9Q3UTH8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef9Q3UTH8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef9Q3UTH8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef9Q3UTH8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arhgef9Q3UTH8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arhgef9Q3UTH8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef9Q3UTH8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arhgef9Q3UTH8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Arhgef9Q3UTH8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arhgef9Q3UTH8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef9Q3UTH8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef9Q3UTH8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgef9Q3UTH8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgef9Q3UTH8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arhgef9Q3UTH8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef9Q3UTH8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef9Q3UTH8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef9Q3UTH8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef9Q3UTH8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arhgef9Q3UTH8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arhgef9Q3UTH8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arhgef9Q3UTH8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arhgef9Q3UTH8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arhgef9Q3UTH8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arhgef9Q3UTH8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arhgef9Q3UTH8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Arhgef9Q3UTH8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arhgef9Q3UTH8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Arhgef9Q3UTH8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arhgef9Q3UTH8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arhgef9Q3UTH8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arhgef9Q3UTH8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgef9Q3UTH8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arhgef9Q3UTH8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgef9Q3UTH8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arhgef9Q3UTH8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgef9Q3UTH8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arhgef9Q3UTH8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgef9Q3UTH8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arhgef9Q3UTH8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arhgef9Q3UTH8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms