Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc190Q3URK1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc190Q3URK1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc190Q3URK1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc190Q3URK1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc190Q3URK1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc190Q3URK1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc190Q3URK1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc190Q3URK1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc190Q3URK1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc190Q3URK1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc190Q3URK1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc190Q3URK1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc190Q3URK1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc190Q3URK1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc190Q3URK1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc190Q3URK1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc190Q3URK1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc190Q3URK1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc190Q3URK1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc190Q3URK1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc190Q3URK1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc190Q3URK1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc190Q3URK1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc190Q3URK1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc190Q3URK1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc190Q3URK1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc190Q3URK1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc190Q3URK1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc190Q3URK1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc190Q3URK1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc190Q3URK1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc190Q3URK1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc190Q3URK1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc190Q3URK1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc190Q3URK1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc190Q3URK1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc190Q3URK1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc190Q3URK1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc190Q3URK1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc190Q3URK1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc190Q3URK1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc190Q3URK1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc190Q3URK1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc190Q3URK1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc190Q3URK1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc190Q3URK1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc190Q3URK1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc190Q3URK1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc190Q3URK1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc190Q3URK1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc190Q3URK1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc190Q3URK1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc190Q3URK1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc190Q3URK1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc190Q3URK1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc190Q3URK1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc190Q3URK1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc190Q3URK1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc190Q3URK1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc190Q3URK1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc190Q3URK1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc190Q3URK1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc190Q3URK1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc190Q3URK1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms