Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ankrd27Q3UMR0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd27Q3UMR0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ankrd27Q3UMR0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd27Q3UMR0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ankrd27Q3UMR0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ankrd27Q3UMR0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd27Q3UMR0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ankrd27Q3UMR0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ankrd27Q3UMR0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ankrd27Q3UMR0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ankrd27Q3UMR0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd27Q3UMR0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd27Q3UMR0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ankrd27Q3UMR0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd27Q3UMR0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd27Q3UMR0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd27Q3UMR0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd27Q3UMR0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd27Q3UMR0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ankrd27Q3UMR0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ankrd27Q3UMR0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ankrd27Q3UMR0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ankrd27Q3UMR0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ankrd27Q3UMR0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ankrd27Q3UMR0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ankrd27Q3UMR0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ankrd27Q3UMR0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ankrd27Q3UMR0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ankrd27Q3UMR0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ankrd27Q3UMR0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ankrd27Q3UMR0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ankrd27Q3UMR0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ankrd27Q3UMR0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ankrd27Q3UMR0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ankrd27Q3UMR0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ankrd27Q3UMR0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ankrd27Q3UMR0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ankrd27Q3UMR0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ankrd27Q3UMR0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ankrd27Q3UMR0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ankrd27Q3UMR0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ankrd27Q3UMR0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ankrd27Q3UMR0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ankrd27Q3UMR0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ankrd27Q3UMR0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ankrd27Q3UMR0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ankrd27Q3UMR0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ankrd27Q3UMR0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ankrd27Q3UMR0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ankrd27Q3UMR0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ankrd27Q3UMR0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ankrd27Q3UMR0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ankrd27Q3UMR0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ankrd27Q3UMR0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ankrd27Q3UMR0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ankrd27Q3UMR0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ankrd27Q3UMR0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ankrd27Q3UMR0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ankrd27Q3UMR0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ankrd27Q3UMR0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ankrd27Q3UMR0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ankrd27Q3UMR0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ankrd27Q3UMR0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ankrd27Q3UMR0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ankrd27Q3UMR0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ankrd27Q3UMR0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ankrd27Q3UMR0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ankrd27Q3UMR0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ankrd27Q3UMR0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ankrd27Q3UMR0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ankrd27Q3UMR0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd27Q3UMR0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms