Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lsg1Q3UM18 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lsg1Q3UM18 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsg1Q3UM18 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsg1Q3UM18 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsg1Q3UM18 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lsg1Q3UM18 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lsg1Q3UM18 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lsg1Q3UM18 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lsg1Q3UM18 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lsg1Q3UM18 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lsg1Q3UM18 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lsg1Q3UM18 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lsg1Q3UM18 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lsg1Q3UM18 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lsg1Q3UM18 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lsg1Q3UM18 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lsg1Q3UM18 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsg1Q3UM18 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsg1Q3UM18 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lsg1Q3UM18 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lsg1Q3UM18 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lsg1Q3UM18 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lsg1Q3UM18 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lsg1Q3UM18 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lsg1Q3UM18 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lsg1Q3UM18 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lsg1Q3UM18 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lsg1Q3UM18 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lsg1Q3UM18 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lsg1Q3UM18 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lsg1Q3UM18 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lsg1Q3UM18 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lsg1Q3UM18 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lsg1Q3UM18 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lsg1Q3UM18 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lsg1Q3UM18 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lsg1Q3UM18 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lsg1Q3UM18 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lsg1Q3UM18 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lsg1Q3UM18 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lsg1Q3UM18 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lsg1Q3UM18 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lsg1Q3UM18 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lsg1Q3UM18 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lsg1Q3UM18 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lsg1Q3UM18 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lsg1Q3UM18 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lsg1Q3UM18 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lsg1Q3UM18 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lsg1Q3UM18 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lsg1Q3UM18 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lsg1Q3UM18 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lsg1Q3UM18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lsg1Q3UM18 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lsg1Q3UM18 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lsg1Q3UM18 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lsg1Q3UM18 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lsg1Q3UM18 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lsg1Q3UM18 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lsg1Q3UM18 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lsg1Q3UM18 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Lsg1Q3UM18 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lsg1Q3UM18 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lsg1Q3UM18 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Lsg1Q3UM18 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lsg1Q3UM18 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lsg1Q3UM18 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lsg1Q3UM18 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lsg1Q3UM18 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lsg1Q3UM18 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lsg1Q3UM18 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lsg1Q3UM18 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lsg1Q3UM18 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lsg1Q3UM18 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lsg1Q3UM18 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lsg1Q3UM18 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lsg1Q3UM18 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lsg1Q3UM18 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lsg1Q3UM18 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lsg1Q3UM18 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lsg1Q3UM18 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lsg1Q3UM18 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lsg1Q3UM18 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lsg1Q3UM18 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lsg1Q3UM18 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lsg1Q3UM18 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lsg1Q3UM18 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lsg1Q3UM18 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lsg1Q3UM18 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lsg1Q3UM18 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lsg1Q3UM18 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lsg1Q3UM18 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lsg1Q3UM18 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lsg1Q3UM18 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lsg1Q3UM18 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lsg1Q3UM18 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lsg1Q3UM18 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lsg1Q3UM18 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lsg1Q3UM18 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms