Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC2

Lrrk1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrk1Q3UHC2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrk1Q3UHC2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrk1Q3UHC2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrk1Q3UHC2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrk1Q3UHC2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrk1Q3UHC2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrk1Q3UHC2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrk1Q3UHC2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrk1Q3UHC2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrk1Q3UHC2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrk1Q3UHC2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrk1Q3UHC2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrk1Q3UHC2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrk1Q3UHC2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrk1Q3UHC2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrk1Q3UHC2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrk1Q3UHC2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrk1Q3UHC2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrk1Q3UHC2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrk1Q3UHC2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrk1Q3UHC2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrk1Q3UHC2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrk1Q3UHC2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrk1Q3UHC2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrk1Q3UHC2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrk1Q3UHC2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrk1Q3UHC2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrk1Q3UHC2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrk1Q3UHC2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrk1Q3UHC2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrk1Q3UHC2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrk1Q3UHC2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrk1Q3UHC2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrk1Q3UHC2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrk1Q3UHC2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrk1Q3UHC2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrk1Q3UHC2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrk1Q3UHC2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrk1Q3UHC2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrk1Q3UHC2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrk1Q3UHC2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrk1Q3UHC2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrk1Q3UHC2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrk1Q3UHC2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrk1Q3UHC2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrk1Q3UHC2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrk1Q3UHC2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrk1Q3UHC2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrk1Q3UHC2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrk1Q3UHC2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrk1Q3UHC2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrk1Q3UHC2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrk1Q3UHC2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrk1Q3UHC2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrk1Q3UHC2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrk1Q3UHC2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrk1Q3UHC2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrk1Q3UHC2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrk1Q3UHC2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrk1Q3UHC2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrk1Q3UHC2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrk1Q3UHC2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrk1Q3UHC2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrk1Q3UHC2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrk1Q3UHC2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrk1Q3UHC2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrk1Q3UHC2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrk1Q3UHC2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrk1Q3UHC2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrk1Q3UHC2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrrk1Q3UHC2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrk1Q3UHC2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrk1Q3UHC2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrrk1Q3UHC2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrk1Q3UHC2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrk1Q3UHC2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrk1Q3UHC2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrk1Q3UHC2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrk1Q3UHC2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrk1Q3UHC2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrk1Q3UHC2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrk1Q3UHC2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrk1Q3UHC2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrk1Q3UHC2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrk1Q3UHC2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrk1Q3UHC2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrk1Q3UHC2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrk1Q3UHC2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrk1Q3UHC2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrrk1Q3UHC2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrk1Q3UHC2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrk1Q3UHC2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrk1Q3UHC2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrk1Q3UHC2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrk1Q3UHC2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrk1Q3UHC2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrk1Q3UHC2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrk1Q3UHC2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrk1Q3UHC2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrk1Q3UHC2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms