Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nom1Q3UFM5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nom1Q3UFM5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nom1Q3UFM5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nom1Q3UFM5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nom1Q3UFM5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nom1Q3UFM5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nom1Q3UFM5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nom1Q3UFM5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nom1Q3UFM5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nom1Q3UFM5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nom1Q3UFM5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nom1Q3UFM5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nom1Q3UFM5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nom1Q3UFM5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nom1Q3UFM5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Nom1Q3UFM5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nom1Q3UFM5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nom1Q3UFM5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nom1Q3UFM5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nom1Q3UFM5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nom1Q3UFM5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nom1Q3UFM5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Nom1Q3UFM5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nom1Q3UFM5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nom1Q3UFM5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nom1Q3UFM5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nom1Q3UFM5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nom1Q3UFM5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nom1Q3UFM5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nom1Q3UFM5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Nom1Q3UFM5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Nom1Q3UFM5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nom1Q3UFM5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nom1Q3UFM5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Nom1Q3UFM5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nom1Q3UFM5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nom1Q3UFM5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nom1Q3UFM5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nom1Q3UFM5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nom1Q3UFM5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nom1Q3UFM5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nom1Q3UFM5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nom1Q3UFM5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nom1Q3UFM5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nom1Q3UFM5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Nom1Q3UFM5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nom1Q3UFM5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nom1Q3UFM5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Nom1Q3UFM5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nom1Q3UFM5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nom1Q3UFM5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nom1Q3UFM5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nom1Q3UFM5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nom1Q3UFM5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nom1Q3UFM5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nom1Q3UFM5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nom1Q3UFM5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nom1Q3UFM5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nom1Q3UFM5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nom1Q3UFM5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nom1Q3UFM5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nom1Q3UFM5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Nom1Q3UFM5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nom1Q3UFM5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nom1Q3UFM5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nom1Q3UFM5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nom1Q3UFM5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nom1Q3UFM5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nom1Q3UFM5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nom1Q3UFM5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nom1Q3UFM5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nom1Q3UFM5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nom1Q3UFM5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nom1Q3UFM5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Nom1Q3UFM5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nom1Q3UFM5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nom1Q3UFM5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nom1Q3UFM5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nom1Q3UFM5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nom1Q3UFM5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Nom1Q3UFM5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nom1Q3UFM5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nom1Q3UFM5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nom1Q3UFM5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nom1Q3UFM5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nom1Q3UFM5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nom1Q3UFM5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nom1Q3UFM5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nom1Q3UFM5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nom1Q3UFM5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nom1Q3UFM5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nom1Q3UFM5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nom1Q3UFM5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nom1Q3UFM5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nom1Q3UFM5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nom1Q3UFM5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nom1Q3UFM5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nom1Q3UFM5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nom1Q3UFM5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms