Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ccdc174Q3U155 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc174Q3U155 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc174Q3U155 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccdc174Q3U155 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ccdc174Q3U155 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc174Q3U155 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc174Q3U155 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccdc174Q3U155 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ccdc174Q3U155 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ccdc174Q3U155 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccdc174Q3U155 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccdc174Q3U155 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc174Q3U155 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc174Q3U155 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc174Q3U155 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ccdc174Q3U155 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ccdc174Q3U155 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc174Q3U155 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ccdc174Q3U155 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccdc174Q3U155 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc174Q3U155 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccdc174Q3U155 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccdc174Q3U155 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccdc174Q3U155 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ccdc174Q3U155 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ccdc174Q3U155 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc174Q3U155 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc174Q3U155 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccdc174Q3U155 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc174Q3U155 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc174Q3U155 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccdc174Q3U155 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ccdc174Q3U155 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc174Q3U155 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccdc174Q3U155 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ccdc174Q3U155 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc174Q3U155 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc174Q3U155 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc174Q3U155 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc174Q3U155 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccdc174Q3U155 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc174Q3U155 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ccdc174Q3U155 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc174Q3U155 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc174Q3U155 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc174Q3U155 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc174Q3U155 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccdc174Q3U155 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccdc174Q3U155 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccdc174Q3U155 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccdc174Q3U155 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ccdc174Q3U155 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ccdc174Q3U155 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccdc174Q3U155 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ccdc174Q3U155 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc174Q3U155 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ccdc174Q3U155 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccdc174Q3U155 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ccdc174Q3U155 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Ccdc174Q3U155 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc174Q3U155 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc174Q3U155 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc174Q3U155 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc174Q3U155 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ccdc174Q3U155 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ccdc174Q3U155 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc174Q3U155 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ccdc174Q3U155 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc174Q3U155 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ccdc174Q3U155 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc174Q3U155 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ccdc174Q3U155 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc174Q3U155 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc174Q3U155 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccdc174Q3U155 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc174Q3U155 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccdc174Q3U155 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ccdc174Q3U155 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc174Q3U155 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccdc174Q3U155 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccdc174Q3U155 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccdc174Q3U155 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccdc174Q3U155 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc174Q3U155 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc174Q3U155 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc174Q3U155 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc174Q3U155 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc174Q3U155 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc174Q3U155 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc174Q3U155 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc174Q3U155 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc174Q3U155 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc174Q3U155 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc174Q3U155 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc174Q3U155 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc174Q3U155 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc174Q3U155 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc174Q3U155 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc174Q3U155 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms