Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TraddQ3U0V2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TraddQ3U0V2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TraddQ3U0V2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TraddQ3U0V2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TraddQ3U0V2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TraddQ3U0V2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TraddQ3U0V2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TraddQ3U0V2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TraddQ3U0V2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TraddQ3U0V2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TraddQ3U0V2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TraddQ3U0V2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TraddQ3U0V2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TraddQ3U0V2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TraddQ3U0V2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TraddQ3U0V2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TraddQ3U0V2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TraddQ3U0V2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TraddQ3U0V2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TraddQ3U0V2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TraddQ3U0V2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TraddQ3U0V2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TraddQ3U0V2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TraddQ3U0V2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TraddQ3U0V2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TraddQ3U0V2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TraddQ3U0V2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TraddQ3U0V2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TraddQ3U0V2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TraddQ3U0V2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TraddQ3U0V2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TraddQ3U0V2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TraddQ3U0V2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TraddQ3U0V2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TraddQ3U0V2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TraddQ3U0V2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TraddQ3U0V2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TraddQ3U0V2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TraddQ3U0V2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TraddQ3U0V2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TraddQ3U0V2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TraddQ3U0V2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TraddQ3U0V2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TraddQ3U0V2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TraddQ3U0V2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TraddQ3U0V2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TraddQ3U0V2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TraddQ3U0V2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TraddQ3U0V2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TraddQ3U0V2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TraddQ3U0V2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TraddQ3U0V2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TraddQ3U0V2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TraddQ3U0V2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TraddQ3U0V2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TraddQ3U0V2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TraddQ3U0V2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TraddQ3U0V2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TraddQ3U0V2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TraddQ3U0V2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TraddQ3U0V2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TraddQ3U0V2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TraddQ3U0V2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TraddQ3U0V2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TraddQ3U0V2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TraddQ3U0V2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TraddQ3U0V2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TraddQ3U0V2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TraddQ3U0V2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TraddQ3U0V2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TraddQ3U0V2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TraddQ3U0V2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TraddQ3U0V2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TraddQ3U0V2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TraddQ3U0V2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TraddQ3U0V2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TraddQ3U0V2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TraddQ3U0V2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TraddQ3U0V2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TraddQ3U0V2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms