Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hp1bp3Q3TEA8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hp1bp3Q3TEA8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hp1bp3Q3TEA8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hp1bp3Q3TEA8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hp1bp3Q3TEA8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hp1bp3Q3TEA8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hp1bp3Q3TEA8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hp1bp3Q3TEA8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hp1bp3Q3TEA8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hp1bp3Q3TEA8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hp1bp3Q3TEA8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hp1bp3Q3TEA8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hp1bp3Q3TEA8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hp1bp3Q3TEA8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hp1bp3Q3TEA8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hp1bp3Q3TEA8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hp1bp3Q3TEA8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hp1bp3Q3TEA8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hp1bp3Q3TEA8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hp1bp3Q3TEA8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hp1bp3Q3TEA8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hp1bp3Q3TEA8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hp1bp3Q3TEA8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hp1bp3Q3TEA8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hp1bp3Q3TEA8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hp1bp3Q3TEA8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hp1bp3Q3TEA8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hp1bp3Q3TEA8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hp1bp3Q3TEA8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hp1bp3Q3TEA8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hp1bp3Q3TEA8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hp1bp3Q3TEA8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hp1bp3Q3TEA8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hp1bp3Q3TEA8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hp1bp3Q3TEA8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hp1bp3Q3TEA8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hp1bp3Q3TEA8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hp1bp3Q3TEA8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hp1bp3Q3TEA8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hp1bp3Q3TEA8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hp1bp3Q3TEA8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hp1bp3Q3TEA8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hp1bp3Q3TEA8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hp1bp3Q3TEA8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hp1bp3Q3TEA8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hp1bp3Q3TEA8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hp1bp3Q3TEA8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hp1bp3Q3TEA8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hp1bp3Q3TEA8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hp1bp3Q3TEA8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hp1bp3Q3TEA8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hp1bp3Q3TEA8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hp1bp3Q3TEA8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hp1bp3Q3TEA8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hp1bp3Q3TEA8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hp1bp3Q3TEA8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hp1bp3Q3TEA8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hp1bp3Q3TEA8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hp1bp3Q3TEA8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hp1bp3Q3TEA8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hp1bp3Q3TEA8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hp1bp3Q3TEA8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms