Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc69Q3TCJ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc69Q3TCJ8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc69Q3TCJ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc69Q3TCJ8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc69Q3TCJ8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc69Q3TCJ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc69Q3TCJ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc69Q3TCJ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc69Q3TCJ8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc69Q3TCJ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc69Q3TCJ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc69Q3TCJ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc69Q3TCJ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc69Q3TCJ8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc69Q3TCJ8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc69Q3TCJ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc69Q3TCJ8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc69Q3TCJ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc69Q3TCJ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc69Q3TCJ8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc69Q3TCJ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc69Q3TCJ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc69Q3TCJ8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc69Q3TCJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc69Q3TCJ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc69Q3TCJ8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc69Q3TCJ8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc69Q3TCJ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc69Q3TCJ8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc69Q3TCJ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc69Q3TCJ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc69Q3TCJ8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc69Q3TCJ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc69Q3TCJ8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc69Q3TCJ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc69Q3TCJ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc69Q3TCJ8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc69Q3TCJ8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc69Q3TCJ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc69Q3TCJ8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc69Q3TCJ8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc69Q3TCJ8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc69Q3TCJ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc69Q3TCJ8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc69Q3TCJ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc69Q3TCJ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc69Q3TCJ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc69Q3TCJ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc69Q3TCJ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc69Q3TCJ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc69Q3TCJ8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc69Q3TCJ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc69Q3TCJ8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc69Q3TCJ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc69Q3TCJ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc69Q3TCJ8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc69Q3TCJ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc69Q3TCJ8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc69Q3TCJ8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc69Q3TCJ8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc69Q3TCJ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc69Q3TCJ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc69Q3TCJ8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc69Q3TCJ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc69Q3TCJ8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc69Q3TCJ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc69Q3TCJ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc69Q3TCJ8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc69Q3TCJ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc69Q3TCJ8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc69Q3TCJ8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc69Q3TCJ8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc69Q3TCJ8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc69Q3TCJ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms