Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smim24Q0VG18 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smim24Q0VG18 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smim24Q0VG18 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smim24Q0VG18 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smim24Q0VG18 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smim24Q0VG18 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smim24Q0VG18 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smim24Q0VG18 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smim24Q0VG18 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smim24Q0VG18 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smim24Q0VG18 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smim24Q0VG18 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smim24Q0VG18 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smim24Q0VG18 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smim24Q0VG18 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smim24Q0VG18 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smim24Q0VG18 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smim24Q0VG18 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smim24Q0VG18 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smim24Q0VG18 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smim24Q0VG18 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smim24Q0VG18 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smim24Q0VG18 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smim24Q0VG18 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smim24Q0VG18 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smim24Q0VG18 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smim24Q0VG18 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smim24Q0VG18 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smim24Q0VG18 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smim24Q0VG18 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smim24Q0VG18 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smim24Q0VG18 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smim24Q0VG18 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smim24Q0VG18 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smim24Q0VG18 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smim24Q0VG18 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smim24Q0VG18 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smim24Q0VG18 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smim24Q0VG18 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smim24Q0VG18 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smim24Q0VG18 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smim24Q0VG18 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smim24Q0VG18 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smim24Q0VG18 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smim24Q0VG18 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smim24Q0VG18 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smim24Q0VG18 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smim24Q0VG18 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smim24Q0VG18 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smim24Q0VG18 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smim24Q0VG18 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smim24Q0VG18 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smim24Q0VG18 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smim24Q0VG18 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smim24Q0VG18 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smim24Q0VG18 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smim24Q0VG18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smim24Q0VG18 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smim24Q0VG18 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smim24Q0VG18 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smim24Q0VG18 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smim24Q0VG18 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smim24Q0VG18 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smim24Q0VG18 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smim24Q0VG18 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smim24Q0VG18 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smim24Q0VG18 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smim24Q0VG18 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smim24Q0VG18 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smim24Q0VG18 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smim24Q0VG18 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smim24Q0VG18 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smim24Q0VG18 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smim24Q0VG18 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smim24Q0VG18 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smim24Q0VG18 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smim24Q0VG18 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smim24Q0VG18 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smim24Q0VG18 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smim24Q0VG18 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smim24Q0VG18 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smim24Q0VG18 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smim24Q0VG18 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms