Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc138Q0VF22 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc138Q0VF22 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc138Q0VF22 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc138Q0VF22 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc138Q0VF22 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc138Q0VF22 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc138Q0VF22 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc138Q0VF22 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc138Q0VF22 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc138Q0VF22 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc138Q0VF22 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc138Q0VF22 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc138Q0VF22 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc138Q0VF22 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc138Q0VF22 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc138Q0VF22 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc138Q0VF22 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc138Q0VF22 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc138Q0VF22 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc138Q0VF22 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc138Q0VF22 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc138Q0VF22 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc138Q0VF22 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc138Q0VF22 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc138Q0VF22 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc138Q0VF22 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc138Q0VF22 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc138Q0VF22 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc138Q0VF22 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc138Q0VF22 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc138Q0VF22 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc138Q0VF22 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc138Q0VF22 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc138Q0VF22 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc138Q0VF22 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc138Q0VF22 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc138Q0VF22 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc138Q0VF22 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc138Q0VF22 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc138Q0VF22 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc138Q0VF22 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc138Q0VF22 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc138Q0VF22 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc138Q0VF22 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc138Q0VF22 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc138Q0VF22 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc138Q0VF22 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc138Q0VF22 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc138Q0VF22 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc138Q0VF22 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc138Q0VF22 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc138Q0VF22 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc138Q0VF22 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc138Q0VF22 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc138Q0VF22 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc138Q0VF22 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc138Q0VF22 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc138Q0VF22 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc138Q0VF22 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc138Q0VF22 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc138Q0VF22 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc138Q0VF22 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc138Q0VF22 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc138Q0VF22 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc138Q0VF22 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc138Q0VF22 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc138Q0VF22 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms