Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cntnap5aQ0V8T9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cntnap5aQ0V8T9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cntnap5aQ0V8T9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cntnap5aQ0V8T9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cntnap5aQ0V8T9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cntnap5aQ0V8T9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cntnap5aQ0V8T9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cntnap5aQ0V8T9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cntnap5aQ0V8T9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cntnap5aQ0V8T9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cntnap5aQ0V8T9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cntnap5aQ0V8T9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cntnap5aQ0V8T9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cntnap5aQ0V8T9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cntnap5aQ0V8T9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cntnap5aQ0V8T9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cntnap5aQ0V8T9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cntnap5aQ0V8T9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cntnap5aQ0V8T9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cntnap5aQ0V8T9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cntnap5aQ0V8T9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cntnap5aQ0V8T9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cntnap5aQ0V8T9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cntnap5aQ0V8T9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cntnap5aQ0V8T9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cntnap5aQ0V8T9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cntnap5aQ0V8T9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cntnap5aQ0V8T9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cntnap5aQ0V8T9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cntnap5aQ0V8T9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cntnap5aQ0V8T9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cntnap5aQ0V8T9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cntnap5aQ0V8T9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cntnap5aQ0V8T9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cntnap5aQ0V8T9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cntnap5aQ0V8T9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cntnap5aQ0V8T9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cntnap5aQ0V8T9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cntnap5aQ0V8T9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cntnap5aQ0V8T9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cntnap5aQ0V8T9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cntnap5aQ0V8T9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cntnap5aQ0V8T9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cntnap5aQ0V8T9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cntnap5aQ0V8T9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cntnap5aQ0V8T9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cntnap5aQ0V8T9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cntnap5aQ0V8T9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cntnap5aQ0V8T9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cntnap5aQ0V8T9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cntnap5aQ0V8T9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cntnap5aQ0V8T9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cntnap5aQ0V8T9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cntnap5aQ0V8T9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cntnap5aQ0V8T9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cntnap5aQ0V8T9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cntnap5aQ0V8T9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cntnap5aQ0V8T9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cntnap5aQ0V8T9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cntnap5aQ0V8T9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cntnap5aQ0V8T9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cntnap5aQ0V8T9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cntnap5aQ0V8T9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cntnap5aQ0V8T9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cntnap5aQ0V8T9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cntnap5aQ0V8T9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cntnap5aQ0V8T9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cntnap5aQ0V8T9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cntnap5aQ0V8T9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cntnap5aQ0V8T9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cntnap5aQ0V8T9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cntnap5aQ0V8T9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cntnap5aQ0V8T9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cntnap5aQ0V8T9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cntnap5aQ0V8T9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cntnap5aQ0V8T9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cntnap5aQ0V8T9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cntnap5aQ0V8T9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cntnap5aQ0V8T9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cntnap5aQ0V8T9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cntnap5aQ0V8T9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cntnap5aQ0V8T9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cntnap5aQ0V8T9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cntnap5aQ0V8T9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Cntnap5aQ0V8T9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cntnap5aQ0V8T9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cntnap5aQ0V8T9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cntnap5aQ0V8T9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cntnap5aQ0V8T9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cntnap5aQ0V8T9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms