Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cntnap5aQ0V8T9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Cntnap5aQ0V8T9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cntnap5aQ0V8T9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cntnap5aQ0V8T9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cntnap5aQ0V8T9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cntnap5aQ0V8T9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cntnap5aQ0V8T9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cntnap5aQ0V8T9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cntnap5aQ0V8T9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cntnap5aQ0V8T9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cntnap5aQ0V8T9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cntnap5aQ0V8T9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cntnap5aQ0V8T9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cntnap5aQ0V8T9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Cntnap5aQ0V8T9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cntnap5aQ0V8T9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cntnap5aQ0V8T9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cntnap5aQ0V8T9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cntnap5aQ0V8T9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cntnap5aQ0V8T9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cntnap5aQ0V8T9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cntnap5aQ0V8T9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cntnap5aQ0V8T9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cntnap5aQ0V8T9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cntnap5aQ0V8T9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cntnap5aQ0V8T9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cntnap5aQ0V8T9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cntnap5aQ0V8T9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cntnap5aQ0V8T9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cntnap5aQ0V8T9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cntnap5aQ0V8T9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cntnap5aQ0V8T9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cntnap5aQ0V8T9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cntnap5aQ0V8T9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cntnap5aQ0V8T9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cntnap5aQ0V8T9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cntnap5aQ0V8T9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cntnap5aQ0V8T9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cntnap5aQ0V8T9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cntnap5aQ0V8T9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cntnap5aQ0V8T9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cntnap5aQ0V8T9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cntnap5aQ0V8T9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cntnap5aQ0V8T9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cntnap5aQ0V8T9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cntnap5aQ0V8T9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cntnap5aQ0V8T9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cntnap5aQ0V8T9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cntnap5aQ0V8T9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cntnap5aQ0V8T9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cntnap5aQ0V8T9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cntnap5aQ0V8T9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cntnap5aQ0V8T9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cntnap5aQ0V8T9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cntnap5aQ0V8T9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cntnap5aQ0V8T9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cntnap5aQ0V8T9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cntnap5aQ0V8T9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cntnap5aQ0V8T9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cntnap5aQ0V8T9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cntnap5aQ0V8T9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cntnap5aQ0V8T9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cntnap5aQ0V8T9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cntnap5aQ0V8T9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cntnap5aQ0V8T9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cntnap5aQ0V8T9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cntnap5aQ0V8T9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cntnap5aQ0V8T9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cntnap5aQ0V8T9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cntnap5aQ0V8T9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cntnap5aQ0V8T9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cntnap5aQ0V8T9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cntnap5aQ0V8T9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cntnap5aQ0V8T9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cntnap5aQ0V8T9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cntnap5aQ0V8T9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cntnap5aQ0V8T9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cntnap5aQ0V8T9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cntnap5aQ0V8T9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cntnap5aQ0V8T9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cntnap5aQ0V8T9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cntnap5aQ0V8T9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cntnap5aQ0V8T9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cntnap5aQ0V8T9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cntnap5aQ0V8T9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cntnap5aQ0V8T9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cntnap5aQ0V8T9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cntnap5aQ0V8T9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cntnap5aQ0V8T9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms